targetscan.hs.eg.db.

DOI:10.18129 / b9.bioc.targetscan.hs.eg.db.

针对人类的TargetScan miRNA目标预测

Biocometiond版本:释放(3.12)

使用来自TargetScan网站的数据组装人类组装的TargetScan miRNA目标预测。TargetScan通过搜索匹配每个miRNA的种子区域的保守的8mer和7mer位点来预测MiRNA的生物学靶标。还鉴定是通过保守的3'配对补偿的种子区域中具有不匹配的位点。在哺乳动物中,基于使用网站的上下文分数计算的靶向的预测功效来排序预测。

作者:Gabor CSardi

维护者:James F. Reid

引文(从R内,输入引文(“targetscan.hs.eg.db”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager :: install(“targetscan.hs.eg.db”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

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Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
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