targetscan.mm.eg.db

doi:10.18129/b9.bioc.targetscan.mm.eg.db

小鼠的靶标miRNA目标预测

生物导体版本:版本(3.15)

Targetscan miRNA的目标预测鼠标的目标预测使用来自TargetScan网站的数据组装。通过寻找与每个miRNA的种子区域相匹配的保守的8mer和7mer位点的存在,可以预测miRNA的生物靶标。还确定的是种子区域中不匹配的位点,这些位点是通过保守3'配对来补偿的。在哺乳动物中,根据使用位点的上下文得分计算的靶向效力对预测进行排名。

作者:gabor csardi

维护者:James F. Reid

引用(从r内,输入引用(“ targetscan.mm.eg.db”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ targetscan.mm.m.eg.db”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册
文本 执照

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 0.6.1
执照 文件执照
要看 R(> = 2.7.0),方法,AnnotationDbi(> = 1.18.3)
进口 方法,AnnotationDbi
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 targetscan.mm.eg.db_0.6.1.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/targetscan.mm.eg.db/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户