GeuvadisTranscriptExpr

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeuvadisTranscriptExpr

来自GEUVADIS项目的带有转录表达和双等位基因型的数据包

Bioconductor版本:发布(3.12)

Lappalainen等人为GEUVADIS项目的CEU个体提供了对应于19号染色体的转录表达和双等位基因型。

作者:Malgorzata Nowicka [aut, cre]

维护人员:Malgorzata Nowicka

安装

要安装这个包，启动R(版本为“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GeuvadisTranscriptExpr")

对于旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的这个包的版本文档，启动R并输入:

browseVignettes(“GeuvadisTranscriptExpr”)

PDF	R脚本	用于sQTL分析的GEUVADIS项目转录本表达和基因型的预处理和制备
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文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.18.0
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.3.0)
进口
链接
建议	limma,rtracklayer,GenomicRanges,Rsamtools,VariantAnnotation、工具、BiocStyle,knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	DRIMSeq
我的链接
构建报告

包档案

遵循安装在你的R会话中使用这个包的说明。

源包	GeuvadisTranscriptExpr_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeuvadisTranscriptExpr
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeuvadisTranscriptExpr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GeuvadisTranscriptExpr/
包下载报告	下载数据