HMP16SData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HMP16SData

来自人类微生物组计划的16S rRNA测序数据

Bioconductor版本:发行版(3.13)

HMP16SData是人类微生物组计划(HMP) 16S rRNA可变区域1-3和3-5测序数据的生物导体实验数据包。原始数据文件从HMP数据分析与协调中心下载。处理后的数据通过ExperimentHub作为summarizeexperiment类对象提供。

作者:Lucas schiffer [aut, cre]， Rimsha Azhar [aut]， Marcel Ramos [ctb]， Ludwig Geistlinger [ctb]， Levi Waldron [aut]

维护者:Lucas schiffer

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HMP16SData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HMP16SData”)

超文本标记语言	R脚本	HMP16SData
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.12.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0.0)，SummarizedExperiment
进口	AnnotationHub，为了，dplyr，ExperimentHub，kableExtra，knitr，magrittr、方法、readr，S4Vectors，stringr，宠物猫,跑龙套
链接
建议	Biobase，BiocCheck，BiocManager，BiocStyle，circlize，covr，cowplot，dendextend，devtools，ggplot2，gridExtra，还，phyloseq，rmarkdown，roxygen2统计数据,testthat，tidyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/waldronlab/HMP16SData
BugReports	https://github.com/waldronlab/HMP16SData/issues
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进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	HMP16SData_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HMP16SData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HMP16SData
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/HMP16SData/
软件包下载报告	下载数据