HMP2DATA

doi:10.18129/b9.bioc.hmp2data

来自人类微生物组项目2的16S rRNA测序数据2

生物导体版本:版本(3.13)

HMP2DATA是人类微生物组项目2(HMP2)16S rRNA测序数据的生物导体包。处理后的数据作为Thyloseq,SummarizedExperiment和MultiasSayExperiment类对象。包装中还提供了用于构建这些S4类对象的单个矩阵和数据。

作者:John Stansfield ,ekaterina smirnova ,ni zhao ,jhu.edu>,jennifer fettweis

维护者:John Stansfield ,ekaterina smirnova

引用(从r内,输入引用(“ HMP2DATA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ hmp2data”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ hmp2data”)

html R脚本 HMP2DATA
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.6.0
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.6.0)
进口 AnnotationHub,,,,断言,,,,dplyr,,,,实验室,,,,KableExtra,,,,尼特,,,,马格里特, 方法,readr,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,,,,门索,,,,多亚sayExexperiment,,,,Data.Table
链接
建议 生物酶,,,,生物检查,,,,生物管理器,,,,生物使用,,,,牛仔图,,,,DevTools,,,,GGPLOT2,,,,栅格,,,,避风港,,,,rmarkDown,,,,roxygen2,统计测试,,,,蒂布尔,,,,insctr
系统要求
增强
URL https://github.com/jstansfield0/hmp2data
BugReports https://github.com/jstansfield0/hmp2data/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 hmp2data_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hmp2data
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/hmp2data
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/hmp2data/
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