纳米果仁糖

doi：10.18129/b9.bioc.nanoporernaseq

纳米孔RNA-seq示例数据

生物导体版本：版本（3.13）

Nanoporernaseq软件包包含使用牛津纳米孔测序生成的长读RNA-seq数据。数据由SG-Nex项目生成的两个人类细胞系（K562和MCF7）的6个样品组成。这些细胞系中的每一个都有三个重复，具有1个直接RNA测序数据和2个cDNA测序数据。读取与22号染色体（GRCH38）对齐，并存储为BAM文件。原始数据来自SG-Nex项目。

作者：Jonathan Goeke开发人员[AUT]，Ying Chen开发人员[CRE]，Yuk Kei Wan Developer [aut]

维护者：ying chen开发人员

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ nanoporernaseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“纳米铜菜”）

html	R脚本	纳米果仁糖
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
执照	GPL-3 +文件执照
要看	r（> = 4.0.0），实验室（> = 1.15.3）
进口
链接
建议	尼特，，，，小班夫，，，，GGBIO，，，，bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38，，，，循环，，，，复杂的图像，，，，apeglm，，，，rlang，，，，基因组签名，，，，rsamtools
系统要求
增强	平行
URL	https://github.com/goekelab/nanoporernaseq
取决于我
进口我
建议我	小班夫
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	nanoporernaseq_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanoporernaseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/nanoporernaseq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/nanoporernaseq/
软件包下载报告	下载统计