RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

来自RNAseq实验的对齐阅读:通过高通量测序HNRNPC敲除和对照HeLa细胞的转录分析

Bioconductor版本:发行版(3.13)

该包包含8个BAM文件，每个排序运行1个。每个BAM文件的获取方法是:(1)用TopHat2将读(配对端)对齐到完整的hg19基因组，然后(2)将子集设置为只保留chr14上的对齐。参见ArrayExpress数据库中登录号为E-MTAB-1147的实验详细信息，包括已发表的研究(由Zarnack等人，2012)和FASTQ文件的链接。

作者:Herve页面

维护器:Hervé Pagès

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" naseqdata . hnrnpc .bam.chr14")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	0.30.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	GenomicAlignments，BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/
取决于我	samExploreR，测序
进口我
建议我	BiocParallel，GenomicAlignments，GenomicFiles，GenomicRanges，咆哮，Rsamtools，SplicingGraphs
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.30.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/
包下载报告	下载数据