single.mtec.transcriptomes.

DOI：10.18129 / b9.bioc.single.mtec.transcriptomes.

单细胞转录组数据和小鼠MTEC细胞分析

Bioconductor版本：释放（3.13）

该数据包包含用于分析单细胞RNA-SEQ的代码，并从标题为：单细胞转录组分析中揭示髓质胸腺上皮细胞中协调异位基因表达模式。本文在自然免疫学16,933-941（2015）中公布。此包中提供的数据对象已经预处理：可以从加入标识符E-MTAB-3346和E-MTAB-3624下载原始数据文件。此数据包的Vignette提供了一种文档和可重复的工作流，其中包括用于从稿件生成每个统计数据和图形的代码。

作者：Alejandro Reyes

维护者：Alejandro Reyes

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！perceneNamespace（“biocmanager”，squily = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“single.mtec.transcriptomes”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“single.mtec.transcriptomes”）

PDF.	r script.	单细胞MTEC数据分析。
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯
版本	1.20.0
执照	LGPL.
依靠	r（> = 3.5.0）
进口
链接到
建议	deseq2.那Genomicranges.那基因组法那Genefilter.那Statmod.那gdata.那rcolorbrewer.那ggplot2.那贡献那簇那线索， 网格，格拉底那GGBIO.那GVIZ.那Geneplotter.那MatrixStats.那Pheatmap.那生物焦那kn
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	single.mtec.transcriptomes_1.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/single.mtec.transcriptomes.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudion.org：包/单个.mtec.transcriptomes
包短网址	https://biocumon.org/packages/single.mtec.transcriptomes/
包裹下载报告	下载统计信息