tmexplorer

doi:10.18129/b9.bioc.tmexplorer

肿瘤微环境单细胞RNA测序数据集和相应的元数据的集合

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包提供了一种工具,可以搜索和下载肿瘤微环境单细胞RNA测序数据集及其元数据的集合。TMExplorer的目标是为希望在单细胞水平研究肿瘤微环境的用户充当单点入口。用户可以使用元数据表快速搜索可用的数据集,然后下载他们感兴趣的用于分析的数据集。

作者:Erik Christensen [AUT,CRE],Alaine Naidas [aut],David Chen [aut],Parisa Shooshtari [aut]

维护者:erik christensen

引用(从r内,输入引用(“ tmexplorer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ tmexplorer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ tmexplorer”)

html R脚本 tmexplorer
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.6.2
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.1),Singlecellexperiment,,,,Biocfilecache
进口 方法,矩阵
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/shooshtarilab/tmexplorer/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tmexplorer_1.6.2.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tmexplorer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tmexplorer
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/tmexplorer/
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