TargetScoreData

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetScoreData

TargetScoreData

Bioconductor版本:发行版(3.16)

来自84个基因表达综合(GEO)系列的mirna过表达折叠变化，对应于6个平台、77个人类细胞或组织和113个不同的mirna。与数据一起，我们还在这个包中包括TargetScanHuman 6.1的序列特征评分，包括上下文+评分和每个miRNA-mRNA相互作用的保守靶向概率。因此，用户可以使用这些基于静态序列的评分，以及用户提供的miRNA过表达引起的组织/细胞特异性折叠变化，使用TargetScore包(单独下载)来预测miRNA靶标。

作者:李越

维护者:Yue Li

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TargetScoreData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TargetScoreData”)

PDF	R脚本	处理的人类microrna过表达数据来自GEO，序列信息来自TargetScan, targetScore来自targetScore
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.34.0
许可证	GPL-2
取决于
进口
链接
建议	TargetScore,gplots
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	TargetScore
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	TargetScoreData_1.34.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetScoreData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TargetScoreData
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TargetScoreData/
软件包下载报告	下载数据