WGSMAPP

doi:10.18129/b9.bioc.wgsmapp

来自编码项目的全基因组测序的可视性轨道

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包提供了人类HG19/HG38组件上的全基因组映射轨道。如果多个编码区域与相同的垃圾箱重叠,我们采用了编码项目的100-MERS映射轨道,并计算出映射得分的加权平均值。包括“黑名单”垃圾箱,包括端粒,丝粒和/或异染色质区域的参考组装中的分段重复区域和差距。该数据集由三个组装的单细胞总基因组测序的组装.BAM文件组成,用于说明目的。

作者:Rujin Wang

维护者:rujin wang

引用(从r内,输入引用(“ WGSMAPP”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ wgsmapp”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

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版本 1.4.0
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.6.0),基因组机
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源包 wgs​​mapp_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wgsmapp
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/wgsmapp
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/wgsmapp/
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