腌制胶癌

DOI：10.18129 / b9.bioc.curatedmetagenomicdata.

人类微生物组的治疗均衡数据

Bioconductor版本：释放（3.13）

含有标准化的，用于新的分析的标准化，策划人微生物组数据。它包括基因家族，标记丰富，标记存在，途径丰度，途径覆盖以及从不同体位收集的样品的相对丰富。使用Metaphlan3计算每个样品的细菌，真菌和古群分类丰富，并用HUMANN3计算代谢功能潜力。手动策划的样本元数据和标准化的偏心组数据可用作（树）概括对象。

作者：Lucas Schiffer [Aut，CRE]，Levi Waldron [Aut]，Edoardo Pasolli [CTB]，Jennifer Wokaty [CTB]，Sean Davis [CTB]，Audrey Renson [CTB]，Chloe Mirzayi [CTB]，Paolo Manghi [CTB]，Samuel Gamboa-Tuz [CTB]，Marcel Ramos [CTB]，Valerie Obenchain [CTB]，Kelly Eckenrode [CTB]，Nicola Segata [CTB]

维护者：Lucas Schiffer

安装

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if（！percenamespace（“biocmanager”，squiatly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“墨水metagenomicdata”）

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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	3.0.1
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 4.1），概括分析那树ummariedexperiment.
进口	annotationhub.那实验室那S4Vectors.那dplyr.那Magrittr.那邮风那rlang.那stringr.那娇媚那Tidyr.那tidyselect.
链接到
建议	生物焦那DT.那kn那米娅那读书那RAMAMAMDOW.那撒尿那testthat.那uwot.那素食主义者
系统要求
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URL.	https://github.com/waldronlab/curatedmetagenomicdata.
Bugreports.	https://github.com/waldronlab/curatedmetagenomicdata/issues.
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包档案包

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源包	CutatedMetageNomicData_3.0.1.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/curatedmetagenomicdata.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/腌制物种
包短网址	https://biocumon.org/packages/curatedmetagenomicdata/
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