HGU133PLUS2CELLSCORE

doi：10.18129/b9.bioc.hgu133plus2cellscore

单元格标准单元类型表达数据集[HGU133PLUS2]

生物导体版本：版本（3.15）

CellScore标准数据集包含来自各种人类细胞和组织的表达数据，这些数据应在细胞索孔的计算中用作标准细胞类型。所有数据均来自公共数据库，例如Gene Expression Omnibus（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）或arrayexpress（https://www.ebi.ac.ac.ac.uk/arrayexpress/）。该标准数据集仅包含来自Affymetrix Genechip人类基因组U133加2.0微阵列的数据。使用数据库信息手动注释样本或咨询数据集发起的出版物。样品注释存储在表达式对象的phodata插槽中。将原始数据（CEL文件）与Affy软件包处理，以生成当前/缺失的呼叫（MAS5CALLS）和背景提取的值，然后通过R-A-A-A-A-Ackage Yugene对其进行标准化，以产生标准表达式矩阵的最终表达值。从Bioc注释软件包HGU133PLUS2检索了微阵列的注释表。所有数据都存储在Expressionset对象中。

作者：Nancy Mah，Katerina Taskova

维护者：nancy mah

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ hgu133plus2cellscore”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

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BrowseVignettes（“ HGU133PLUS2CellScore”）

PDF	R脚本	r软件包：HGU133PLUS2CELLSCORE
PDF		参考手册

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.16.0
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.5.0）
进口	生物酶（> = 2.39.1）
链接
建议	尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	细胞索
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	HGU133PLUS2CELLSCORE_1.16.0.TAR.GZ
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hgu133plus2cellscore
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/hgu133plus2cellscore
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/hgu133plus2cellscore/
软件包下载报告	下载统计