simpIntLists

DOI:10.18129 / B9.bioc.simpIntLists

该软件包以简单的格式包含各种生物的生物网格交互作用

Bioconductor版本:Release (3.15)

该软件包包含拟南芥(thale cress)、秀丽隐杆线虫、果蝇、人类、小鼠、酵母(出芽酵母)和S.pombe(裂变酵母)的BioGRID相互作用。Entrez id,官方名称和唯一id可以用来寻找蛋白质。交互的格式是列表。对于每个基因/蛋白质,列表中都有一个条目,其中“name”包含基因/蛋白质的名称,“interactors”包含与其相互作用的基因/蛋白质列表。

作者:Kircicegi Korkmaz, Volkan Atalay, Rengul Cetin-Atalay

维护者:Kircicegi Korkmaz

引文(从R内,输入引用(“simpIntLists”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“simpIntLists”)

PDF R脚本 simpIntLists
PDF 参考手册

细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.32.0
许可证 GPL (>= 2)
取决于
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 ibh
进口我
建议我 GeneNetworkBuilder
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 simpIntLists_1.32.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simpIntLists
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/simpIntLists
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/simpIntLists/
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