SystemPiperData

doi：10.18129/b9.bioc.systempiperdata

SystemPiperData：工作流模板和示例数据

生物导体版本：版本（3.15）

SystemPiperData是一个辅助软件包，可以使用单个命令NGS Workflow模板生成，该模板旨在由其父封装Systempiper使用。后者是一个用于构建端到端分析管道的环境，其下一代序列（NGS）应用程序（例如RNA-Seq，Ribo-Seq，Chip-Seq，chip-Seq，var-Seq等）具有自动报告生成。使用SystemPiperData的详细示例在SystemPiper的概述Vignette中给出。

作者：托马斯·吉尔克（Thomas Girke）

维护者：thomas girke

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ SystemPiperData”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

BrowseVignettes（“ SystemPiperData”）

html	R脚本	SystemPiperData：工作流模板和示例数据
html	R脚本	WF：Chip-Seq工作流模板
html	R脚本	WF：Ribo-Seq工作流模板
html	R脚本	WF：RNA-Seq工作流模板
html	R脚本	WF：var-seq模板
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	2.0.1
执照	艺术2.0
要看
进口	方法，生物弦，，，，生物基因，，，，jsonlite，，，，远程
链接
建议	GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，iranges，，，，rsamtools，，，，Shortread，，，，rtracklayer，，，，运行，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Systempiper
系统要求
增强
URL	https://github.com/tgirke/systempiperdatahttps://systempipe.org/
取决于我
进口我	rnaseqr
建议我	Systempiper，，，，SystemPipeshiny
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	systempiperdata_2.0.1.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/systempiperdata
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/systempiperdata
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/systempiperdata/
软件包下载报告	下载统计