生物导体版本:发布(3.13)
该包提供了在GEUVADIS项目的一组6个RNA-seq样本上运行各种转录丰度量词的输出。量词为袖扣(Cufflinks)、RSEM、卡利斯托(kallisto)、鲑鱼(Salmon)和旗鱼(Sailfish)。有关版本号、示例信息和调用的详细信息,请参见包小插图。
作者:迈克尔的爱
维护者:Michael Love
引文(从R中输入引用(“tximportData”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install("tximportData")
有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“tximportData”)
超文本标记语言 | R脚本 | txport的示例输出文件 |
参考手册 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.20.0 |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | crossmeta,DESeq2,鱼池,HumanTranscriptomeCompendium,tximeta,tximport,variancePartition |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | tximportData_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximportData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tximportData |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/tximportData/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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