1.6.0版更改新增特性- scMultiome 1.0.1版为RNAseq数据提供了10X格式。错误修复和小的改进-更新seqFISH小插图和文档。-更新到summarizeexperiment中检查assayDimnames的更改。- scNMT默认为1.0.0版本的QC过滤单元格。有关未过滤的单元格，请参见?scNMT中的版本部分。新特性- SingleCellMultiModal函数允许多种多模态技术的组合。-来自Macaulay等人的GTseq数据(2015)现在可用(@lgeistlinger) -来自Specht等人的SCoPE2数据现在可用，感谢@cvanderaa (#26) - scMultiome提供来自10X Genomics的PBMC，感谢@rargelaguet错误修复和微小改进-元数据信息(函数调用和对技术映射的调用)包括在SingleCellMultiModal中- scNMT包括MultiAssayExperiment元数据中的原始调用-改进和编辑的贡献指南的清晰性- seqFISH使用基于SpatialExperiment的更改(@drighelli) -在CITEseq (@drighelli)中的sampleMap中删除了额外的列(@drighelli， #18) -新特性- CITEseq函数，vignette和'cord_blood'数据可用(@drighelli， #18) -包括seqFISH函数，vignette和'mouse_visual_cortex'数据(v1和v2来自@drighelli， #14) -新的'mouse_gastrulation'数据集发布(版本“2.0.0”)。-使用version参数来指示mouse_gastrulation数据版本-数据包括所有细胞，而不仅仅是通过所有三个组学QC的细胞(感谢@rargelaguet， @ajabadi)。错误修复和小的改进-缓存机制使用工具::R_user_dir而不是rappdirs。 - Improved display of available data using ExperimentHub metadata. - Improved documentation explaining versioning differences. - Contribution guidelines available at https://github.com/waldronlab/SingleCellMultiModal/wiki/Contributing-Guidelines - Default version argument in scNMT function now set to "2.0.0" (version "1.0.0" still available) Changes in version 1.0.0 New features - scNMT serves the mouse gastrulation dataset from Argelaguet et al. 2019 - Data set is provided by Argelaguet and colleagues via CloudStor link: https://cloudstor.aarnet.edu.au/plus/s/Xzf5vCgAEUVgbfQ - GitHub repository for the dataset by the authors available at: https://github.com/rargelaguet/scnmt_gastrulation Bug fixes and minor improvements - Row names in the scNMT dataset properly show mouse ENSEMBL identifiers