1.7.1版更改(2022-04-07)-删除了过时的小插图,现在我们转而指向耦耦器和耦耦器-py的最新小插图。版本1.5.2(2021-10-13)的更改- Daniel Dimitrov被分配为新的维护者版本1.4.2(2021-10-08)的更改-修复了懒惰数据警告-改进了测试覆盖率版本1.4.1(2021-05-25)的更改-重建所有规则-修复了小鼠规则中模糊的调节模式1.3.2(2021-03-09)版本的更改-添加了用于癌症的泛癌症规则。版本1.2.1的更改(2021-02-08)-修复了Seurat相关单元测试中的错误,因为Seurats包更新到版本4.0。s@assays$dorothea@misc现在是list(),之前是NULL。1.1.2(2020-10-08)版本更改-将TF普查从TFclass更改为Lambert等人的最新版本。每个TF(激活剂,抑制剂,双联)的调控模式的信息仍然取自Garcia-Alonso等人。-使用limma包更新基因符号到其最新别名(版本3.44.3)。-在DESCRIPTION文件中将viper包从suggest移到depends。为run_viper.Seurat()增加了一个参数,以选择一个特定的化验名称,从中提取归一化的基因表达值。版本1.1.1的更改(2020-09-02)-导出df2regulon()函数-改进的文档(将gh页URL添加到DESCRIPTION)版本1.0.1的更改(2020-08-13)-改进的包文档-更新到单细胞vignette中10倍基因组学数据集的链接-修复了与Seurat和SCE类相关的测试版本1.0.0的更改(2020-04-27)-在Bioconductor正式发布3.11版本0.99.9的更改(2020-04-22)-集成Travis CI -集成单元测试覆盖与 covr::codecov - Build github page via pkgdown Changes in version 0.99.1 (2020-04-06) - If the input to the viper wrapper is a Bioconductor class, this Bioconductor class is retured with added TF activities at appropiate slots - Expanded the viper wrapper to the Bioconductor class SingleCellExperiment Changes in version 0.99.0 (2020-04-03) - Initial submission to Bioconductor