# #——风格,回声= FALSE,结果= '飞机 '------------------------------------ BiocStyle:减价 () ## ----------------------------------------------------------------------------- ## 加载包库(HarmanData)数据(IMR90)数据(NPM)数据黄韧带骨化病例(Infinium5)简称OLF)数据。数据(1:5,1:5)暗(olf.data)表(olf.info ) ## ----------------------------------------------------------------------------- ## 加载包库(HarmanData)数据(Infinium5) lvr。哈曼(“cg01381374) md.harman(“cg01381374 ", ] ## ----------------------------------------------------------------------------- 库(Harman)数据(反射幻灯机)bad_batches < - c(1、5、9、17、25)is_bad_sample < -反射幻灯机pd array_num美元%,% bad_batches myK < - discoverClusteredMethylation(反射幻灯机原始美元[,! is_bad_sample]) mykClust = kClusterMethylation(反射幻灯机原始美元,row_ks = myK) res = clusterStats (pre_betas =反射幻灯机原始美元,post_betas =反射幻灯机哈曼美元,kClusters = mykClust)。equals (episcope$ref_md$meandiffs_harman, res$meandiffs)平等(反射幻灯机ref_lvr var_ratio_harman美元,res log2_var_ratio美元)