ExpressionNormalizationWorkflow

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExpressionNormalizationWorkflow

基因表达规范化工作流程

生物导体版本:发布(3.12)

一个广泛的、定制的表达规范化工作流程，结合微阵列的监督规范化(SNM)、代理变量分析(SVA)和主方差成分分析来识别批效应，并将其从表达数据中移除，以提高检测潜在生物信号的能力。

作者:Karthikeyan Murugesan [aut, cre]， Greg Gibson [sad, ths]

维护者:Karthikeyan Murugesan

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("ExpressionNormalizationWorkflow")

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文档

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browseVignettes(“ExpressionNormalizationWorkflow”)

超文本标记语言

R脚本

基因表达规范化工作流程

细节

biocViews	GeneExpressionWorkflow,ImmunoOncologyWorkflow,工作流
版本	1.16.0
许可证	GPL (> = 3)
取决于
进口	Biobase(> = 2.24.0),limma(> = 3.20.9),lme4(> = 1.1.7),matrixStats(> = 0.10.3),pvca(> = 1.4.0),球形结构(> = 1.12.0),股东价值分析(> = 3.10.0),vsn(> = 3.32.0)
链接
建议	knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ExpressionNormalizationWorkflow_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionNormalizationWorkflow
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExpressionNormalizationWorkflow
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ExpressionNormalizationWorkflow/
包下载报告	下载数据