rprimer

DOI:10.18129 / B9.bioc.rprimer

从多个DNA序列比对设计简并寡核苷酸

Bioconductor版本:发行版(3.15)

功能、工作流程和一个用于可视化序列保存和设计简并引物、探针和(RT)-(q/d)PCR分析的Shiny应用程序。结果可以以数据帧格式显示，并可视化为类似仪表板的图。有关更多信息，请参阅包装插图。

作者:Sofia Persson [aut, cre]

维护者:Sofia Persson

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rprimer")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“rprimer”)

超文本标记语言	R脚本	使用说明的
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，报道，MultipleSequenceAlignment，SequenceMatching，软件，ddPCR，qPCR
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2)
进口	Biostrings，bslib，DT，ggplot2，IRanges，mathjaxr、方法、拼接而成，reshape2，S4Vectors，闪亮的，shinycssloaders，shinyFeedback
链接
建议	BiocStyle，covr，kableExtra，knitr，rmarkdown，斯泰勒，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/sofpn/rprimer
BugReports	https://github.com/sofpn/rprimer/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	rprimer_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	rprimer_1.0.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	rprimer_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rprimer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rprimer
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rprimer/
包下载报告	下载数据