单

DOI:10.18129 / B9.bioc.single

从纳米孔读取基因文库的精确一致序列

Bioconductor版本:Release (3.15)

从纳米孔读取DNA基因文库的精确一致序列。SINGLe纠正了基因文库的纳米孔测序读取中的系统错误，它检索了条形码识别的变体的真实一致序列，每个变体只需要几次读取。更多信息见预印本doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.25.007146。

作者:Rocio Espada [aut, cre]

维护者:Rocio Espada < Rocio . Espada at espci.fr>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“单一”)

超文本标记语言	R脚本	单
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	测序，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.1)
进口	Biostrings，BiocGenerics，dplyr，GenomicAlignments，IRanges、方法、reshape2，rlang，Rsamtools统计数据,stringr，tidyr,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	single_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	single_1.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	single_1.0.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/single
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/single
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/single/
软件包下载报告	下载数据