snpStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.snpStats

SnpMatrix和XSnpMatrix类和方法

Bioconductor版本:Release (3.15)

大型SNP关联研究的类和统计方法。这扩展了早期的snpMatrix包，允许基因型的不确定性。

作者:David Clayton

维护者:David Clayton

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“snpStats”)

PDF	R脚本	数据输入
PDF	R脚本	置
PDF	R脚本	归因和元分析
PDF	R脚本	LD统计
PDF	R脚本	主成分分析
PDF		snpMatrix-differences
PDF	R脚本	snpStats介绍
PDF	R脚本	TDT)测试
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneticVariability，微阵列，单核苷酸多态性，软件
版本	1.46.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(11.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)，生存，矩阵、方法
进口	图形，grDevices，统计，utils，BiocGenerics，zlibbioc
链接
建议	hexbin
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	MAGAR
进口我	DExMA，GeneGeneInteR，gwascat，ldblock，马提尼，旅游房车，scoreInvHap
建议我	crlmm，GenomicFiles，GWASTools，omicRexposome，omicsPrint，VariantAnnotation
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	snpStats_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	snpStats_1.46.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	snpStats_1.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpStats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/snpStats
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/snpStats/
软件包下载报告	下载数据