tomoseqr

DOI:10.18129 / B9.bioc.tomoseqr

分析Tomo-seq数据的R包

Bioconductor版本:发行版(3.15)

' tomoseqr '是一个用于分析Tomo-seq数据的R包。Tomo-seq是一种全基因组RNA断层扫描方法，将高通量RNA测序与冷冻切片相结合，用于空间解析转录组学。' tomoseqr '从tomo-seq数据重构3D表达模式，并将重构的3D表达模式可视化。

作者:Ryosuke Matsuzawa

维护者:Ryosuke Matsuzawa

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tomoseqr")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“tomoseqr”)

超文本标记语言	R脚本	tomoseqr
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression，RNASeq，测序，软件，空间，转录组，可视化
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.2)
进口	grDevices、图形动画，宠物猫，dplyr，stringr，purrr、方法、闪亮的，BiocFileCache，readr、工具
链接
建议	rmarkdown，knitr，BiocStyle，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	tomoseqr_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	tomoseqr_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64)	tomoseqr_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tomoseqr
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tomoseqr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/tomoseqr/
包下载报告	下载数据