的作用

DOI:10.18129 / B9.bioc.uSORT

作用:self-refining订购基因选择的管道

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包的目的是发现内在细胞从单细胞RNA-seq发展路径数据。它包含了数据预处理、初步PCA基因选择、初步的细胞排序,特征选择,精细胞排序,后分析解释和可视化。

作者:陈麦刘、陈郝Jinmiao陈

维护人员:陈郝< chen_hao在immunol.a-star.edu.sg >

从内部引用(R,回车引用(的作用)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“作用”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(的作用)

HTML R脚本 快速启动
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBiology,DNASeq,GUI,ImmunoOncology,RNASeq,软件
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.3.0), tcltk
进口 igraph、矩阵、RANN RSpectra、VGAM gplots,平行,plyr,方法,集群,Biobasefpc,BiocGenerics,单片眼镜、grDevices图形、属性、跑龙套
链接
建议 RUnit knitr, testthat ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 uSORT_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 uSORT_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) uSORT_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) uSORT_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uSORT
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/作用
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/uSORT/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/uSORT/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置: