vidger

DOI:10.18129 / B9.bioc.vidger

创建快速的可视化RNAseq R中的数据

Bioconductor版本:版本(3.17)

vidger的目的是快速生成信息丰富的可视化解释结果从三个基因差异表达的广泛使用的工具:Cuffdiff DESeq2,磨边机。

作者:布兰登Monier (aut (cre),亚当McDermaid (aut),赵京(aut),秦马(aut(曾经)

维护人员:布兰登Monier <布兰登。在gmail.com monier >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“vidger”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“vidger”)

HTML	R脚本	可视化与ViDGER RNA-seq数据
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,可视化
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (> = 3.5)
进口	Biobase,DESeq2,刨边机,ggplot2 GGally ggrepel、knitr RColorBrewer, rmarkdown,尺度,统计数据,SummarizedExperiment、tidyr跑龙套
链接
建议	BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/btmonier/vidger//www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/vidger.html
BugReports	https://github.com/btmonier/vidger/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	vidger_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	vidger_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)	vidger_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	vidger_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vidger
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ vidger
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/vidger/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/vidger/
包下载报告	下载数据