zellkonverter

DOI:10.18129 / B9.bioc.zellkonverter

scRNA-seq对象之间的转换

Bioconductor版本:发行版(3.16)

提供在Python AnnData对象和singlecel实验对象之间转换的方法。这些主要供下游Bioconductor包使用，这些包包装了用于单细胞数据分析的Python方法。它还包括读写用于将AnnData对象保存到磁盘的H5AD文件的函数。

作者:Luke Zappia [aut, cre]， Aaron Lun [aut]

维护者:Luke Zappia < Luke at lazappi.id.au>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“zellkonverter”)

超文本标记语言	R脚本	转换到/从AnnData到singlecel实验
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，SingleCell，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于
进口	矩阵，蛇怪，网状，SingleCellExperiment(> = 1.11.6),SummarizedExperiment，DelayedArray、方法、S4Vectors跑龙套,cli
链接
建议	anndata，BiocFileCache，BiocStyle，covr，HDF5Array，knitr，pkgload，rmarkdown，rhdf5，scRNAseq，拼写，testthat，withr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/theislab/zellkonverter
BugReports	https://github.com/theislab/zellkonverter/issues
全靠我	OSCA.intro
进口我	伶盗龙
建议我	cellxgenedp，HDF5Array
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	zellkonverter_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	zellkonverter_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	zellkonverter_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	zellkonverter_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zellkonverter
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/zellkonverter
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/zellkonverter/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/zellkonverter/
软件包下载报告	下载数据