登录
报名
关于
常问问题
问一个问题
最新的
消息
工作
教程
标签
用户
最新帖子
最新的
消息
工作
教程
论坛
标签
行星
用户
登录
报名
关于
关于
常问问题
限制
整天
今天
本星期
这个月
今年
未得到答复
所有帖子
种类
更新
答案
书签
创建
答复
秩
视图
投票
显示:
差异
•
重置
1
投票
2
答复
59
视图
差异如何处理单端和配对数据
差异
SSSS
10天前•更新1小时前
1831513
•0
0
投票
6
答复
693
视图
diffbind:高度错误 * sapply(称为,函数(x)x)
差异
DBA
峰会
3.1年前
Zhaolin20042008
•0
•2小时前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
3
答复
66
视图
conc_1在Divernet dba中。报告结果略有不同
差异
4天前
Shangguandong1996
•20
•2小时前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
2
答复
69
视图
差异是否正确地指定峰值变化很小的峰具有统计学意义?
deseq2
差异
6天前•5天前更新
山姆
•0
1
投票
8
答复
130
视图
Windows上不支持DIFFBIND“ MC.CORS”> 1
差异
10天前•7天前更新
通用
•10
5
投票
6
答复
113
视图
检查/更新软件包版本
差异
10天前•9天前更新
伯特布
•0
0
投票
1
回复
55
视图
difbind误差带有背景= true在dba中。
生物比较
差异
平行
12天前
胜利者
•0
•12天前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
2
投票
8
答复
197
视图
使用差异黑名单和灰画列表,结果映射到BDGP6
差异
19天前
山姆
•0
•5天前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
4
答复
133
视图
BAM文件在dba.analyze()中导致黑名单错误(),但在dba.blacklist()中却没有
差异
15天前•5天前更新
Ahua217
•0
5
投票
8
答复
626
视图
通过diffbind与deseq2的相互作用
差异
deseq2
互动
3.2年前
rbronste
•60
•20天前更新
皮埃尔。马林
•0
5
投票
7
答复
206
视图
学习差异 - 一些基本问题
差异
28天前
山姆
•0
•6天前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
2
投票
1
回复
64
视图
在差异上迷惑PCA图
差异
27天前
山姆
•0
•27天前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
3
投票
4
答复
166
视图
剪切并运行差异和DESEQ2的归一化
基因组化
deseq2
剪切
差异
正常化
5周前•4周前更新
莫妮卡
•20
0
投票
2
答复
98
视图
使用dba.count()时差异错误
芯片-rx
差异
chipseq
7周前•5周前更新
Indi97
•0
0
投票
3
答复
119
视图
使用差异的三种组织类型之间峰的维恩图
差异
6周前
Divya
•0
•6周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
2
投票
7
答复
172
视图
ATAC-SEQ的差异中的归一化
差异
6周前
Debayan
•0
0
投票
6
答复
190
视图
有关差异的峰和重新计数读数的问题
差异
7周前•6周前更新
Tongjun
•0
1
投票
9
答复
237
视图
差异正在失去峰
差异
10周前•6周前更新
塞巴斯蒂安
•0
0
投票
5
答复
138
视图
芯片SEQ分析通过差异软件包
差异
芯片
7周前
Shrinka.Genetics
•0
•2小时前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
5
答复
146
视图
错误报告在DIFFBIND中加载DBA对象的0字节床文件时
差异
6周前
Ahua217
•0
•6天前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
10
答复
258
视图
错误报告在diffbind中使用dab()
差异
10周前•7周前更新
Ahua217
•0
0
投票
2
答复
99
视图
差异:所有样品均为所有基因计数0。
差异
Genrich
8周前
peris_baba
•0
•7周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
1
回复
75
视图
差异报告错误
差异
8周前
Bei Jun
•0
•8周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
0
答复
86
视图
芯片寻求者注释错误
差异
chipseq
Chipseeker
chipdb
注解
9周前
3月
•0
4
投票
5
答复
828
视图
差异中的多因素阻止
差异
差异结合分析
多因素设计
3.3年前
Jared.andrews07
•10
0
投票
3
答复
453
视图
是否有可能在差异中指定用于DESEQ2分析的尺寸因子?
差异
正常化
4.5年前
nfursova.msu
•0
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
2
答复
503
视图
差异PE数据
差异
配对末端读取
4.0年前
rbronste
•60
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
3
答复
441
视图
有没有一种方法可以在没有标准化的情况下运行差异?
差异
差异结合分析
2.4年前
托马斯
•10
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
2
答复
291
视图
具有高度可变的FRIP(分数读数为峰)的差异
差异
23个月前
GFM
•20
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
2
投票
5
答复
149
视图
如何在差异中获取估计的Libsize
差异
7个月前
Shangguandong1996
•20
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
2
答复
111
视图
我可以使用DESEQ2完全重复差异结果吗?
差异
7个月前
Shangguandong1996
•20
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
2
答复
96
视图
在差异中使用多个协变量
差异
deseq2
10个月前
Bioinfouser2
•10
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
4
答复
771
视图
Manorm输出作为差异输入。
Manorm
差异
正常化
chipseq
3.0年前
Ajeet
•0
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
2
投票
4
答复
217
视图
在差异峰分析之前集成计算的尖峰系数以进行标准化
差异
chipseq
尖刺
14个月前
Konstantin Okonechnikov
•20
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
8
答复
122
视图
差异多重阻断因子
差异
罗里·史塔克(Rory Stark)
芯片SEQ
9个月前
Bioinfouser2
•10
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
2
答复
255
视图
差异多组
差异
23个月前
文斯·舒尔茨(Vince Schulz)
•60
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
4
投票
3
答复
145
视图
用于回归多个混杂变量(阻止因子)的差异
差异
堵塞
回归
deseq2
chipseq
14个月前
梅尔努斯
•10
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
2
答复
67
视图
差异自定义标准化因子
差异
9个月前
C t
•140
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
投票
2
答复
134
视图
差异有多个阻止因素
差异
阻止
模型
15个月前
梅尔努斯
•10
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
3
答复
972
视图
在散发到差异之前,降低了带有尖峰的芯片序列BAM文件
差异
chipseq
chipqc
2.9年前
Bioinfouser2
•10
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
1
回复
195
视图
消息:
Diffbind 3.0中的广泛更新
正常化
Atacseq
chipseq
差异
chipseq
11周前
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
1
回复
78
视图
ATAC-SEQ计数提取的差异
esatac
EDGER
差异
11周前
蒂莫西
•0
•11周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
10
答复
239
视图
diffbind for Atacseq无重复
差异
Atacseq
复制
12周前
编码
•60
•9周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
2
投票
8
答复
764
视图
差异如何基于峰值数据运行PCA?
差异
3.4年前
加里
•20
•11周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
2
答复
118
视图
sum中的diffbind错误(sapply(peaks,nrow)):参数的无效'type'(列表)
差异
12周前
Alessandro.Testori
•0
•12周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
2
投票
2
答复
81
视图
[dba.plotvenn]我可以在图中移动数字以使它们适合重叠区域内吗?
差异
阴谋
维恩图
3个月前
Jiekwo1
•0
•3个月前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
1
回复
81
视图
DBA的错误。计数和DBA。
差异
chip-seq
差异结合位点
3个月前
3月
•0
•3个月前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
1
投票
5
答复
131
视图
是否有可能使用超过5种dba.overlap进行分析?
差异
4个月前
QQ809825706
•0
•12周前更新
Lindsaynhayes
•0
0
投票
0
答复
75
视图
如何通过DBA提取峰热图内的信息。PlotheatMap
差异
4个月前
QQ809825706
•0
2
投票
4
答复
104
视图
从差异中提取的计数可以用来在DESEQ2中作为RNASEQ分析吗?
deseq2
差异
4个月前
QQ809825706
•0
•4个月前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
457结果•页面
第10个中的1
最近的 ...
答复
答:如何使用集群profiler的富集
经过
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
如果您使用的是 *salmo salar *nbci基因id,并希望您可以使用一个``orgdb'',其中包含 *danio rerio *的ncbi基因ID,那么我c…
答案:GenomeInfodb ::: makenewseqnames中的错误
经过
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
如果您与基于Enembl的基因组保持一致,那么您的染色体就不会以“ CHR”开头。相反,它们将是1-22,X,Y,MT
答:Diffbind如何一起处理单端和配对数据
经过
1831513
•0
非常感谢您的帮助!按照您的脚本,我得到了单端和配对数据的正确读数,并运行DBA.A…
答案:diffbind:高度错误 * sapply(称为,函数(x)x)
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
我假设您已经更新了原始帖子以来的软件?`sessionInfo()`的当前输出是什么。如果您可以给我发送一个链接…
评论:conc_1在differnet dba中。报告结果略有不同
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
`dba.plotma()`使用`(abs(fold)> = fold)&(fdr <= th)`。对于集中问题,如果您可以向我发送一个可以访问您的链接…
投票
答案:txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene“ txname”不再是UCSC样式,但
答:Diffbind如何一起处理单端和配对数据
答:用DESEQ2中的APEGLM解释LFCSHRINK()的结果
答:通过不平衡组大小的桅杆单细胞RNA-seq分析
单细胞RNA-seq分析通过不平衡组大小的桅杆
奖项
• 全部
预言家
至
伊利斯
•0
流行问题
至
索菲·马里恩·德·普罗斯
•0
预言家
至
Jol.espinoz
•30
史诗般的问题
至
Jol.espinoz
•30
流行问题
至
JMA1991
•40
位置
• 全部
美国,
28分钟前
德国,
32分钟前
爱尔兰共和国,
39分钟前
纽约市,
43分钟前
Embl Heidelberg / de.nbi,
51分钟前
内容
搜索
用户
标签
徽章
帮助
关于
常问问题
使用权
RSS
API
统计
本网站的使用构成接受我们的
用户协议和隐私政策
。
由
版本2.3.3