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11.
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16.
答案
10k.
的观点
DESeq2:添加注释(从数据帧)到DESeqDataSet
deseq2
注解
隆重
6.2年前
Darya Vanichkina
•120.
•26天前更新
mschmidt
•10
1
投票
3.
答案
77
的观点
合并相邻的基因组片段
隆重
GenomicRanges
5周前
rahnaman
•10
0.
投票
4.
答案
92
的观点
Genbank的基因信息(古代+序列)
隆重
基因组范围
genbankr
ensembldb
9周以前
Biomiha.
•20
•9周前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
0.
投票
1
回复
68
的观点
在使用排列测试对复合基因组范围进行重叠过度表示方面需要帮助
林
隆重
iranges
7个月前
梁的天使
•0
•10周前更新
伯纳卡尔
•130
6.
投票
3.
答案
102.
的观点
如何基于染色体(和近似区域)子集换曲对象?
隆重
3个月前
deep
•10
•3个月前更新
mmfansler
•20
3.
投票
7.
答案
112.
的观点
granges / gfeatures:保留Cdsbyoverlaps输出中的所有父列
隆重
GenomicRanges
基因组法
cdsByOverlaps
困惑
4个月前
vanbelj
•10
•4个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
8.
投票
10.
答案
133.
的观点
比较两个范围,检查第一个范围是否包含在另一个范围中。
隆重
IRanges
6个月前
Omarrafiqued
•50
•6个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
2
投票
2
答案
67
的观点
如何访问Galignments对象的元数据
rtracklayer
RSAMTOOLS.
Galignments.
隆重
元数据
7个月前
罗伯特。
•10
•7个月前更新
HervéPagès.
14 k
1
投票
1
回复
79
的观点
rtracklayer导出granges对象作为bigwig错误:功能无法重叠
rtracklayer
Genomicranges.
隆重
8个月前
ssabri
•20
•8个月前更新
迈克尔劳伦斯
11K.
7.
投票
13.
答案
226.
的观点
如何使用基因组核细胞对所有蛋白质编码基因和LNCRNA进行派对分数?
基因组织
隆重
phastcons100way.ucsc.hg38
R.
rtracklayer
9个月前
生物学家
•90
•9个月前更新
罗伯特卡斯特罗
♦2.6 k
0.
投票
6.
答案
93
的观点
Genomicranges:找到第一,第二和第三最近基因
R.
GenomicRanges
隆重
10个月前
ssabri
•20
•10个月前更新
戈登·斯密
41K.
0.
投票
1
回复
126.
的观点
在与Granges的基因组横跨基因组中计算和绘制百叶窗的含量
bioconductor
biostrings
GC内容
biostring
隆重
13个月前
atotalamateur
•0
•13个月前更新
HervéPagès.
14 k
3.
投票
12.
答案
201.
的观点
了解group_by,dress_ranges,
plyranges
隆重
13个月前
Konstantinos Yeles.
•40
•13个月前更新
lee.s
•70
4.
投票
9.
答案
208.
的观点
使用基因组范围来获得非重叠(非冗余)区域的数量
Genomicranges.
隆重
格兰德莱斯列表
R.
15个月前
new_user6
•0
•15个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
7.
投票
8.
答案
4.6 k
的观点
如何从Granges删除绑定的行
隆重
格兰德莱斯列表
5.2年前
vinod.acear.
•50
•17个月前更新
balwierz
•40
3.
投票
10.
答案
1.1K.
的观点
从Granges对象中提取元数据,每个基因组坐标
GenomicRanges
隆重
17个月前
罗伯特。
•10
4.
投票
2
答案
341.
的观点
从ipo中构建gpo
Genomicranges.
隆重
GPO.
2.2年前
maltethodberg
•140
•18个月前更新
HervéPagès.
14 k
0.
投票
2
答案
630.
的观点
基因组ranges错误地构建了田庄
隆重
20个月前
rhooads7
•0
•20个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
2
投票
1
回复
215.
的观点
TXDB对象包含有关非转录活动区域的信息吗?
TXDB.
隆重
bsgenome.
变异注释
21个月前
Jacorvar.
•40
•21个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
4.
投票
1
回复
246.
的观点
推荐覆盖经文的SEQINFO的推荐方式是什么?
隆重
seqinfo
import.bw.
bigwigfile.
rtracklayer
21个月前
maltethodberg
•140
•21个月前更新
迈克尔劳伦斯
11K.
1
投票
3.
答案
308.
的观点
获得5'上游区域的坐标,直到最近的编码区域
R.
隆重
启动子
22个月前
eggrandio
•0
•21个月前更新
HervéPagès.
14 k
2
投票
1
回复
466.
的观点
创建一个矩阵来显示多个田庄之间的重叠
R.
隆重
GenomicRanges
22个月前
维尼休斯·恩里克·达·席尔瓦
•40
•22个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
3.
投票
2
答案
417.
的观点
如何在封装“chipseeker”中使用AnnotatePeak中的EnsdB
隆重
Chipseeker.
annotatePeak
TXDB.
EnsDb
22个月前
焚风
•60.
•22个月前更新
Johannes Rainer.
♦1.7 k
5.
投票
8.
答案
643.
的观点
来自Fasta文件的范围
biostrings
Fasta.
Genomicranges.
隆重
22个月前
Konstantinos Yeles.
•40
•22个月前更新
马丁•摩根
25K.
0.
投票
4.
答案
288
的观点
从Granges分数的变更符号可视化负股数据
隆重
rtracklayer
22个月前
Ferbecneu.
•0
•22个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
3.
投票
12.
答案
374.
的观点
mclapply循环一个GRangesList对象
GenomicRanges
隆重
GRangesList
平行
mclapply.
22个月前
焚风
•60.
0.
投票
1
回复
248.
的观点
创建Granges对象
微阵列
Minfi.
GenomicRatio
隆重
甲基化
23个月前
lalchungnungabt17
•0
•更新23个月前
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
2
投票
4.
答案
364.
的观点
从TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19中提取外显子信息的问题。已知基因:不正确的外显子数量和重叠的外显子
TXDB.
txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.
隆重
外显子
UCSC.
2.0年前
olavur
•10
•2.0年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
0.
投票
1
回复
270.
的观点
如何覆盖调格级的构造函数?
Genomicranges.
隆重
2.0年前
Shaurya Jauhari
•0
3.
投票
7.
答案
4.7 k
的观点
不重叠的田垄(或相反的子集重叠)
隆重
Genomicranges.
iranges
subsetByOverlaps
5.2年前
vinod.acear.
•50
•2.0年前更新
DoubleHelix31.
•0
1
投票
2
答案
322.
的观点
通过基因名获取GRanges对象
隆重
基因符号
德国兹
2.1年前
阿尔曼沙哈萨
•10
2
投票
4.
答案
319.
的观点
基于mcols值将GRanges拆分到GRangeList
隆重
2.1年前
unamourdeswann.
•10
•2.1年前更新
迈克尔劳伦斯
11K.
1
投票
2
答案
345.
的观点
将AME .tsv文件拆分为granges对象或dataframe
MEME.
ame.
主题
dataframe
隆重
2.1年前
rbronste
•60.
•2.1年前更新
迈克尔劳伦斯
11K.
2
投票
1
回复
342.
的观点
gpos目标的范围内变换?
Genomicranges.
GPO.
隆重
2.2年前
maltethodberg
•140
•2.2年前更新
HervéPagès.
14 k
0.
投票
3.
答案
542.
的观点
选择列形成格兰奇对象列表
R.
隆重
画眉山庄
2.2年前
G.K.
•0
2
投票
2
答案
1.2K.
的观点
连接基因组范围的列表
R.
隆重
Genomicranges.
2.3年前
G.K.
•0
•2.3年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
4.
投票
8.
答案
441.
的观点
最接近断点的基因
隆重
plyranges
2.3年前
波格丹
•610年
•2.3年前更新
戈登·斯密
41K.
0.
投票
1
回复
631.
的观点
getPromoterSeq error " error in value[[3L]](cond): record 1 (1:-XXXX-XXX) was truncated"错误描述
getPromoterSeq
隆重
基因组法
2.3年前
杰瑞威1987
•0
5.
投票
9.
答案
453.
的观点
SubsetByoverLaps:比较Granges并将所有信息保持在metaColumns中
隆重
床铺
相交
2.3年前
波格丹
•610年
•2.3年前更新
lee.s
•70
1
投票
1
回复
288
的观点
子集GANGES OBJEXT.
隆重
构造子集
2.3年前
lalchungnungabt17
•0
•2.3年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
0.
投票
7.
答案
598
的观点
计算多个床文件的平均分数
芯片SEQ.
隆重
R.
床文件
2.4年前
jinseok
•0
•2.4年前更新
spotifywebplayer.
•0
2
投票
1
回复
394
的观点
在GrangeS交互中重命名SEQLEVELS错误
互动
隆重
2.5年前
维尼休斯·恩里克·达·席尔瓦
•40
•2.5年前更新
亚伦Lun
♦26K.
0.
投票
4.
答案
564.
的观点
合并基因组范围列表的每个元素
TXDB.
隆重
CDS
羊痘疮
R.
2.5年前
Q.Thomas.
•0
•2.5年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
0.
投票
1
回复
351.
的观点
探测距离最小的地点
R.
Genomicranges.
隆重
画眉山庄
2.7年前
G.K.
•0
0.
投票
0.
答案
341.
的观点
DEXSEQ分析的元数据表
Dexseq.
使用微分对碘氧基苯甲醚
同种型
汇总over.
隆重
2.7年前
一种
•40
1
投票
2
答案
436.
的观点
检测Grange对象内的重叠
R.
画眉山庄
隆重
iranges
2.7年前
G.K.
•0
•2.7年前更新
迈克尔劳伦斯
11K.
0.
投票
1
回复
336.
的观点
r_granges_adding合并的元数据列
隆重
findoverlaps.
2.7年前
me.saichi
•0
2
投票
2
答案
422.
的观点
2KB窗口内的功能,但重新采样
Genomicranges.
隆重
滑动窗口
2.8年前
bruce01campus
•0
•2.8年前更新
迈克尔劳伦斯
11K.
2
投票
7.
答案
523.
的观点
基于字符列表拆分格式对象的线条
隆重
格兰德莱斯列表
2.8年前
斯蒂芬。威廉姆斯
•10
•2.8年前更新
迈克尔劳伦斯
11K.
3.
投票
2
答案
730.
的观点
Coverage()输出SimplerLelist无法转换为Granges
臭虫
Genomicranges.
隆重
rlelist.
报道
2.9年前
xiaotong.yao23
•10
•2.9年前更新
HervéPagès.
14 k
195个结果•页面
1的4
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答案
评论:CNETPOT(ENRICHPLOT)中的颜色刻度不在0中居中,偏向于积极
通过
圭多Hooiveld
♦2.8 k
所以如果我理解正确的话,你不喜欢cnetplot使用的默认颜色梯度(即蓝-白-红),而是喜欢…
答案:矩阵未满秩(一组协变量时间序列实验)
通过
迈克尔爱
31K.
在现在的另一个帖子中链接到我的答案:https://support.biococtor.org/p/97705/#p133790
评论:DESEQ2模型 - 如何在考虑账户时测试案例/控制时间课程模型
通过
迈克尔爱
31K.
如果您控制主题,则不需要(并且无法)控制主学科协变量。但是,这种统计设计又一系......
注释:ReadAffy不考虑参数sampleNames与表型数据对象
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
55K.
这不是affy包的问题,也不是ReadAffy包的问题。问题是,你正在创建一个不匹配的“表型数据”对象……
注释:ReadAffy不考虑参数sampleNames与表型数据对象
通过
Bastien_Chassagnol.
•0
谢谢你的回复,但我不希望那行。我的permodata的names匹配文件名中读到的文件,我希望它匹配,什么时候......
投票
答:阅读。idat函数读取压缩文件时发生误导错误
答:阅读。idat函数读取压缩文件时发生误导错误
从相同GC内容的HG38中检索区域和具有元素列表的长度
从相同GC内容的HG38中检索区域和具有元素列表的长度
C:ClusterProfiler - Generatio&NB在Dotplo中总是正相关
奖项
•所有
预言家
至
Heikki.sarin.
•0
赞赏
至
托马斯Girke
♦1.7 k
伟大的问题
至
珍妮德尼奇
♦2.0 k
学生
至
珍妮德尼奇
♦2.0 k
伟大的问题
至
svlachavas
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位置
•所有
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