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RNA-seq
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235
的观点
来自tximeta的summarizeToGene:不是所有的“rnames”都被找到或唯一。
RNA-seq
tximeta
5周前•28天前更新
迈尔斯·A
•20
0
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96
的观点
Limma/Voom归一化计数
limma
RNA-seq
五星期前
jackiesalzbank
•0
•5周前更新
戈登•史密斯
41 k
0
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2
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105
的观点
RNA-seq读取模拟对标差异表达/剪接方差
聚酯
模拟
RNA-seq
syntheticdata
8星期前
Endre塞巴斯蒂
•60
•8周前更新
戈登•史密斯
41 k
0
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1
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64
的观点
使用GAGE的通路分析返回所有NA值
计
rna-seq
pathwayanalysis
10周前
microPhD
•0
•10周前更新
凯文Blighe
2.3 k
1
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4
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148
的观点
DESeq2:何时拆分多组样品以获得“更”准确的尺寸因子、分散度等。
分散
RNA-seq
DESeq2
几个团体
10周前
凯伦
•0
0
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3.
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108
的观点
GSVA在2个基因的基因集中
GSVA
基因集
RNA-seq
3个月前
Endre塞巴斯蒂
•60
•11周前更新
罗伯特Castelo
♦2.6 k
0
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3.
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137
的观点
在植物基因图谱研究中,一组奇怪的样本在DESeq2归一化后出现过度校正
RNA-Seq
DESeq2
12周前
julie.green
•0
•11周前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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95
的观点
如何通过WGCNA在不同平台的2个数据集之间找到共识模块
consensusmodule
微阵列
RNA-seq
WGCNA
12周前
modarzi
•10
0
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0
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91
的观点
工作:
生物信息学开发人员/计算生物学家
生物信息学
rna-seq
闪闪发光的应用
R
算法开发
工作
3个月前
mmartin
•20
0
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70
的观点
circRNAprofiler - miRNA结合位点
circRNA
RNA-seq
circRNAprofiler
3个月前
泰拉
•0
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72
的观点
HISAT2/StringTie/Ballgown用于新型转录异构体差异表达
同种型
RNA-seq
hisat2
stringtie
舞会礼服
3个月前
ra711
•0
3.
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3.
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173
的观点
任何时候都要理解交互问题
RNA-seq
刨边机
的相互作用
3个月前
vm.higareda
•10
•3个月前更新
戈登•史密斯
41 k
0
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3.
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114
的观点
细菌RNA-seq数据通路分析
注释
rna-seq
路径分析
3个月前
microPhD
•0
5
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6
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179
的观点
RUVseq在斑马鱼大脑RNA-seq数据集中删除一个库大小的人工制品
RUVSeq
RUV
RNA-seq
3个月前
karissa.barthelson
•20
•3个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
3.
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1
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101
的观点
如何在edgeR中创建目标数据框架?
刨边机
RNA-SEQ
3个月前
泰拉
•0
•3个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
投票
1
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94
的观点
在ReportingTools::publish()从Bioconductor映射基因id时出现问题。
ReportingTools
RNA-Seq
RMarkdown
4个月前
anthony.nash
•20
•4个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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4
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110
的观点
DESeq2 LRT用于时间课程实验的问题
rna-seq
R
DESeq2
轻轨车
4个月前
luke.briody
•10
•4个月前更新
凯文Blighe
2.3 k
0
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1
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76
的观点
dupRadar: 150bp PE RNAseq重复率低
dupRadar
150个基点
RNA-seq
5个月前
olegderyagin
•0
•5个月前更新
sergisayolspuig
•60
0
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4
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180
的观点
使用不同的LFC收缩估计器对峰值归一化RNA-seq数据进行估计
deseq2
apeglm
rna-seq
激增
5个月前
nadezda.fursova
•0
•5个月前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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1
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243
的观点
WGCNA中模块隶属度的计算
WGCNA
RNA-seq
ModuleMembership
网络
中心基因
5个月前
ag1805x
•50
•5个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
0
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0
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101
的观点
工作:
科学家1,生物信息学(研究|,加州伯克利|全职)
生物信息学
药物
RNA-seq
CRISPR
工作
5个月前
yzhang
•0
0
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0
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176
的观点
工作:
德国保罗-埃利希研究所新冠病毒基因组学和转录组学博士后
rna-seq
系统发生学
蛋白质建模
单细胞测序
工作
5个月前
liam.childs
•0
0
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1
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126
的观点
处理多重重叠和多重映射读取
RNA-seq
featureCounts
ht-seq
5个月前
ag1805x
•50
•5个月前更新
swbarnes2
•620年
1
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2
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134
的观点
DESeq2多因素设计公式
deseq2
RNA-Seq
6个月前
海伦娜
•0
•6个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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2
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120
的观点
cmdscale()错误:NA值不允许在'd',请求帮助。
cmdscale
zinbwave
scRNA-seq
单细胞测序
RNA-seq
7个月前
Wagaa
•10
•6个月前更新
大卫。risso
•850年
7
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6
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92
的观点
奇怪的DESeq2结果-在有太多零的基因中有很高的意义
deseq2
rna-seq
6个月前
mbk0asis
•0
•6个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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0
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57
的观点
用ropls包创建s图
s-plot
ropls
opls-da
rna-seq
6个月前
andreia
•0
1
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2
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67
的观点
EdgeR阻塞因子-缺失配对样本
刨边机
刨边机
RNA-seq
微分表达式分析
阻碍因素
6个月前
露西
•0
•6个月前更新
戈登•史密斯
41 k
0
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2
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132
的观点
DESeq2关于转换的疑问+ nbinomWaldtest警告
rna-seq
deseq2
警告
nbinomWaldTest
转换
6个月前
andreia
•0
•6个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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0
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33
的观点
路径视图:为什么有些基因没有颜色?
pathview
rna-seq
6个月前
okna0215
•0
1
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0
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146
的观点
工作:
生物信息学数据分析师
R
RNA-seq
工作
工作
7个月前
António米格尔·德·杰西·多明戈斯
•480年
1
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4
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94
的观点
如何比较单个RNA-Seq样本与微阵列样本?
轰
rna-seq
微阵列
7个月前
山姆
•0
•7个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
2
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5
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99
的观点
不要让TopGo修剪长GO名称
去
软件错误
topgo
rna-seq
7个月前
morteza.aslanzadeh
•20
0
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2
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64
的观点
rlog和VSD转换的规范化
deseq2
rna-seq
R
7个月前
thjnant
•10
•7个月前更新
凯文Blighe
2.3 k
3.
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8
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92
的观点
DESeq2中的归一化
deseq2
rna-seq
7个月前
thjnant
•10
•7个月前更新
凯文Blighe
2.3 k
1
投票
3.
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206
的观点
多组不同碱基的两两比较
deseq2
rna-seq
r
7个月前
thjnant
•10
•7个月前更新
迈克尔的爱
31 k
2
票
6
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156
的观点
线性混合模型使用edgeR+limma
线性混合模型
刨边机
limma
轰
RNA-seq
8个月前
weichengz
•0
•8个月前更新
戈登•史密斯
41 k
1
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7
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90
的观点
DESeq2中的高padj
deseq2
RNA-seq
微
8个月前
saulwang0102
•10
•8个月前更新
凯文Blighe
2.3 k
1
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2
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48
的观点
子集VST计数从一个数据集
deseq2
rna-seq
8个月前
一个
•40
•8个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
票
1
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68
的观点
RNA-seq工作流程:基因级探索性分析和差异表达的数据文件在哪里?
rna-seq
9个月前
anamarija
•10
•8个月前更新
凯文Blighe
2.3 k
3.
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4
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168
的观点
DESeq2中大量L2FC
deseq2
ashr
rna-seq
8个月前
亚历克斯
•0
1
投票
1
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86
的观点
EDASeq基因长度归一化
edaseq
r
rna-seq
8个月前
karla.ruizce30
•0
•8个月前更新
凯文Blighe
2.3 k
0
票
1
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54
的观点
在deseq2中产生曼哈顿情节有问题
deseq2
RNA-seq
9个月前
adeler001
•0
•9个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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0
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45
的观点
从BatchQC Shiny App导出结果
BatchQC
RNA-seq
R
闪亮的
batch-effect
9个月前
manninm
•0
0
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5
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74
的观点
在Deseq 2中使用原始pvalue而不是调整pvalue
DESeq2
RNA-seq
9个月前
adeler001
•0
•9个月前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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4
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155
的观点
DESeq2错误:'DESeq2'的包或命名空间加载失败
RNA-Seq
DESeq2
9个月前
DataFanatic
•0
•9个月前更新
艾伯特什
30.
2
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1
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188
的观点
批量纠错纠错遇到错误
后面;
batch-correction
mnncorrect
fastmnn
rna-seq
16个月前
说明了
•20
•9个月前更新
亚伦Lun
♦26 k
4
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3.
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79
的观点
Rsamtools summarizeOverlaps产生低计数
Rsamtools
summarizeOverlaps
RNA-seq
9个月前
liorglic
•10
•9个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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0
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82
的观点
如何从GOseq富集的Reactome通路中鉴定差异表达基因?
goseq
去
rna-seq
9个月前
hasse.bossenbroek
•0
3.
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5
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109
的观点
如何基于deseq R包对GEO预处理的RNA-Seq数据进行过滤和DE分析
deseq
rna-seq
过滤
德
deseq2
9个月前
svlachavas
•770年
•9个月前更新
迈克尔的爱
31 k
373个结果
1 / 8
最近……
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答案:Limma帮助(创建设计矩阵)
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
在你的例子中,没有必要做第二行。limma包很乐意接受一个“ExpressionSet”作为输入,所以你不需要…
答:Rhdf5lib安装问题
通过
迈克•史密斯
♦4.8 k
谢谢你告诉我细节。错误发生在以下步骤:' ' ' ../libtool: line 7486: cd: -/: invalid option ' ' ' and I think…
注释:两种具有不同文库大小的批量RNA数据集的归一化
通过
迈克尔的爱
31 k
考虑到组织嵌套在数据集中,并且您对观察组织内的时间差感兴趣,我建议处理…
注释:两种具有不同文库大小的批量RNA数据集的归一化
通过
K。
•0
我想检索所有组织中特定通路激活后的靶基因列表,以评估到何种程度是靶基因…
答:对两个具有不同文库大小的批量RNA数据集进行归一化
通过
迈克尔的爱
31 k
兴趣的比较是什么?
票
注释:两种具有不同文库大小的批量RNA数据集的归一化
如何更好地设计一个火山情节
用生物串中的另一个核苷酸序列替换特定位置的特定核苷酸序列
评论:如何更好地设计一个火山情节
答:Deseq2中P个调整值
奖
•所有
先知
来
ilysR
•0
受欢迎的问题
来
苏菲·玛丽恩·德·普罗斯
•0
先知
来
jol.espinoz
•30
史诗的问题
来
jol.espinoz
•30
受欢迎的问题
来
jma1991
•40
位置
•所有
德国,
1分钟前
美国,
17分钟前
美国,
23分钟前
WEHI,澳大利亚墨尔本,
1小时前
美国,
1小时前
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