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Rsamtools
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74
的观点
在Rsamtools中支持CSI索引
Rsamtools
7周前•6周前更新
bernatgel
•130年
6
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5
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173
的观点
用Rsamtools从Fasta文件中提取序列
Rsamtools
7个月前
jlee
•20
•10周前更新
马丁•摩根
25 k
0
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47
的观点
如何在sam文件堆中获取插入/删除的序列大小(例如使用Rsamtools)
Rsamtools
连环相撞
插入
删除
4个月前
madsheilskov
•0
4
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3.
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246
的观点
Rsamtools不适用于(R版本4.0.2)
Rsamtools
6个月前
yusuke_suita
•10
2
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2
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81
的观点
如何访问GAlignments对象的元数据
rtracklayer
Rsamtools
GAlignments
农庄
元数据
8个月前
罗伯特。
•10
•8个月前更新
Herve页面
14 k
0
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5
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138
的观点
ATACSeqQC -使用mm10分割文件时出错
atacseqqc
atac-seq
R
bioconductor
rsamtools
8个月前
rita.monteiro
•0
•8个月前更新
凯文Blighe
2.3 k
0
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36
的观点
RSAMTOOLS分析BED文件
RSAMTOOLS
BED-FILE
8个月前
r.mulder01
•0
4
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3.
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82
的观点
Rsamtools summarizeOverlaps产生低计数
Rsamtools
summarizeOverlaps
RNA-seq
9个月前
liorglic
•10
•9个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
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2
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68
的观点
Rsamtools/GenomicAlignments分割错误
Rsamtools
GenomicAlignments
9个月前
格雷姆刺
•10
•9个月前更新
马丁•摩根
25 k
0
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1
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40
的观点
通过readlength对bamfile进行子集设置,并提取SNV在这些reads length上的分布信息
Rsamtools
9个月前
alexandr.gopanenko
•20
•9个月前更新
马丁•摩根
25 k
1
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6
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119
的观点
Rsamtools堆积函数
Rsamtools
连环相撞
读取数
11个月前
mgray
•10
•11个月前更新
马丁•摩根
25 k
0
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2
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45
的观点
Rsamools中scanBam函数的问题
Rsamtools
scanBAM
11个月前
owen.donohoe
•0
•11个月前更新
马丁•摩根
25 k
0
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0
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111
的观点
Rsamtools / rtracklayer为BAM文件创建csi索引
rsamtools
rtracklayer
14个月前•13个月前更新
ATpoint
•390年
5
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15
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451
的观点
在Windows 10下,scanBam和countBam会提前结束
Rsamtools
16个月前
戈登•史密斯
41 k
•16个月前更新
Herve页面
14 k
0
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1
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143
的观点
Rsamtools:如何通过ScanbamParam提取唯一对齐的单端或配对端
Rsamtools
16个月前
Jiping王
•70年
•16个月前更新
马丁•摩根
25 k
0
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1
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144
的观点
错误:“bumphunter”的包或命名空间加载失败:命名空间:Rsamtools未导出对象“path”
minfi
bumphunter
Rsamtools
18个月前
Boran高
•0
1
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8
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439
的观点
如何使用Rsamtool或GenomicAlignments计算RAN-seq读覆盖曲线
Rsamtools
GenomicAlignments
RNA-seq覆盖评分
19个月前
Jiping王
•70年
•19个月前更新
Herve页面
14 k
1
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1
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179
的观点
使用Rsamtools中的tagFilter排除带有特定标记的读取
rsamtools
19个月前
liz.ingsimmons
•140年
•19个月前更新
马丁•摩根
25 k
9
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32
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1.5 k
的观点
Rsamtools v 1.99.6安装错误
Rsamtools
BiocManager
R为3.6
ubuntu
20个月前
kubovcij
•0
•20个月前更新
Herve页面
14 k
3.
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3.
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215
的观点
如何告诉一个GAlignmentsList单例是mate1或mate2
Rsamtools
GenomicAlignments
GAlignmentsList
21个月前
焚风
•60
•21个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
7
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6
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396
的观点
比较和过滤两个BAM文件,每次一条记录
Rsamtools
21个月前
戈登•史密斯
41 k
•21个月前更新
马丁•摩根
25 k
0
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2
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186
的观点
如果'which'在ScanBamParam中有重叠的读取,则有重复读取
文档
Rsamtools
GenomicAlignments
22个月前
莫特
•0
2
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3.
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343
的观点
indexBam(), summarizeOverlaps()错误:RNA-seq
genomicAlignments
RNA-seq
Rsamtools
23个月前
mat149
•40
•23个月前更新
迈克•史密斯
♦4.8 k
0
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1
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245
的观点
用Rsamtools拼接大型bam文件
Rsamtools
23个月前
戴安娜
•10
•23个月前更新
马丁•摩根
25 k
2
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5
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714
的观点
加载Gviz包对象路径错误,未通过命名空间:Rsamtools导出
gviz
rsamtools
2.0年前
frequena.sanchez
•0
2.0年前更新
solutionsweb770
•0
0
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1
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266
的观点
情节被覆盖而不是重叠
rsamtools
ggplot2
情节
2.1年前
mictadlo
•0
•2.1年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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1
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341
的观点
子集bam文件在R
rsamtools
genomicalignments
genomicranges
2.1年前
ferbecneu
•0
•2.1年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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4
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275
的观点
Rsamtools是补充参数无效
rsamtools
isSupplementary
scanbamparam
scanbamflag
countbam
2.2年前
galeoni
•0
•2.2年前更新
马丁•摩根
25 k
1
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6
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451
的观点
在Rsamtools中索引大染色体(如wheat) bam文件
沪深指数
Rsamtools
小麦
2.3年前
saripalligautam86
•10
0
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0
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226
的观点
在Rsamtools中索引大染色体(如wheat) bam文件
Rsamtools
QSEA
MEDIPS
2.3年前
saripalligautam86
•10
1
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2
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390
的观点
使用scanBam的自定义函数的速度和内存
rsamtools
scanbamparam
bam
2.3年前
António米格尔·德·杰西·多明戈斯
•480年
•2.3年前更新
马丁•摩根
25 k
0
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2
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478
的观点
从RE消化的genome .bed文件中提取fasta序列
biostrings
genomicalignments
rsamtools
2.4年前
ferbecneu
•0
•2.4年前更新
Herve页面
14 k
1
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1
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374
的观点
如何解析补充(不是次要)对齐
genomicalignments
rsamtools
2.4年前
马可·布兰切特
•30
•2.4年前更新
马丁•摩根
25 k
0
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6
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604
的观点
Rsamtools未定义符号:gzopen64
Rsamtools
gzopen64
zlib
2.4年前
他双
•0
•2.4年前更新
马丁•摩根
25 k
0
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5
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326
的观点
当读取带有scanBam和ScanBamParam的标签时,可能会导致警告的错误
Rsamtools
2.5年前
罗伯特·k·布拉德利
•40
•2.5年前更新
马丁•摩根
25 k
0
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1
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363
的观点
使用rsamtools提取DNA序列时出错
rsamtools
2.7年前
hwu12
•10
0
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1
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673
的观点
Rsamtools:从BAM或SAM文件中分离映射和未映射的读取(对于新手)
R
测序
对齐
rsamtools
映射
2.7年前
nginet
•0
•2.7年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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0
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389
的观点
使用BamViews的summarizeOverlaps方法占用大量内存
genomicalignments
rsamtools
BamViews
summarizeoverlaps
2.8年前
alex.gos90
•10
•更新于2.8年前
马丁•摩根
25 k
3.
票
2
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333
的观点
在全基因组范围内以10kb区域计算测序读数
读计数
CNV
rsamtools
2.9年前
波格丹
•610年
•2.9年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
票
0
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511
的观点
Rsamtools插入大小
rsamtools
samtools
bam
bowtie2
2.9年前
伊戈尔
•40
7
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2
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423
的观点
Rsamtools::pileup的例子坏了吗?
连环相撞
rsamtools
3.0年前
杰里米莱比锡
•70年
•3.0年前更新
马丁•摩根
25 k
1
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2
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1.1 k
的观点
错误:对象路径未通过命名空间:Rsamtools导出
包
安装问题
rsamtools
chippeakanno
ensembldb
3.1年前
inzirio
•10
0
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2
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585
的观点
Rsamtools ScanFA错误
rsamtools
3.1年前
andreag1987
•0
3.
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2
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1.0 k
的观点
Rsamtools用于R 3.4.1版
rsamtools
包安装
samtools
3.1年前
rbronste
•60
•3.1年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
投票
5
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1.9 k
的观点
Rsamtools:系统。文件未找到文件
rsamtools
bam文件
3.4年前
seungjoon.kim
•0
•3.4年前更新
马丁•摩根
25 k
3.
票
4
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813
的观点
samtools在R中加载
samtools
rsamtools
3.5年前
rbronste
•60
•3.5年前更新
马丁•摩根
25 k
1
投票
3.
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660
的观点
Rsamtools ScanBamParam mapqfilter可能存在问题
rsamtools
scanbamparam
mapqfilter
3.5年前
Devin王
•20
5
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4
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844
的观点
如何从多个位置对齐的读中提取读对齐
rsamtools
genomicalignments
genomicfeatures
3.5年前
罗伯特Castelo
♦2.6 k
•3.5年前更新
达里奥Strbenac
♦1.5 k
1
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4
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689
的观点
如何找到读的结束位置?
rsamtools
对齐
雪茄
3.6年前
Frocha
•10
2
票
6
回复
1.1 k
的观点
提取等位基因读计数-第2部分
rsamtools
variantannotation
3.8年前
波格丹
•610年
•3.8年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
156个结果•页面
1 / 4
最近……
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注释:在特定位置用另一个核苷酸序列替换特定的核苷酸序列
通过
Konstantinos叶尔
•40
你好@Benjamin-24571为你的例子,我可以建议你这段代码:读取<- c("1","2","3","4")序列<- c("ACACCCACG", "AA…
评论:芯片序列分析由DiffBind包
通过
shrinka.genetics
•0
您好,感谢您的回复。我改变了我的文件格式,现在它运行了。它也给了一块地。所有文件都在同一个目录下。不…
答:在Docker中安装Bioconductor包
通过
Konstantinos叶尔
•40
你好,@adklt -21974我在docker中安装包的方法是这样的:FROM bioconductor/bioconductor_docker…
评论:HTqPCR:处理技术重复(过滤类别)和无法肛门
通过
larissa.stanberry
•0
我也遇到了同样的问题。过滤似乎不携带featureData除了featurename,例如调用featureD…
备注:设计矩阵为DESeq2或EdgeR
通过
凯文Blighe
2.3 k
在Biostars上交叉发布:https://www.biostars.org/p/484823/
票
答:Biocthis GHA最近在macOS上失败了
答案:Limma帮助(创建设计矩阵)
注释:两种具有不同文库大小的批量RNA数据集的归一化
如何更好地设计一个火山情节
用生物串中的另一个核苷酸序列替换特定位置的特定核苷酸序列
奖
•所有
先知
来
ilysR
•0
受欢迎的问题
来
苏菲·玛丽恩·德·普罗斯
•0
先知
来
jol.espinoz
•30
史诗的问题
来
jol.espinoz
•30
受欢迎的问题
来
jma1991
•40
位置
•所有
海边的城市,
44分钟前
WEHI,澳大利亚墨尔本,
2小时前
意大利萨莱诺大学,
7小时前
美国,
7小时前
爱尔兰共和国,
7小时前
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