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子群落:比较granges并保留所有信息
格兰格
床
相交
2.4年前
Bogdan
•610
•2。4年前更新
李
•70
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552
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计数读数为diffbind :: dba。不重新介入吗?
差异
chipseq
计数
峰
床
2.7年前
ni-ar
•10
•2。7年前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
0
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0
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354
视图
我需要测量PAR-CLIP数据到RNA区域的距离
parclip
床
床文件
GFF3
3.0年前
Linuxborg2
•0
1
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1
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341
视图
根据基因组注释过滤床文件
床文件
床
过滤
chipseq
3.0年前
rbronste
•60
•3.0年前更新
亚伦·伦
♦26K
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535
视图
错误:Helloranges评估
Helloranges
床
3.6年前
Bioinf
•10
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889
视图
最小重叠以汇总lapplaps()呼叫命中
总结
床
4.9年前
tmartinez
•0
6结果•页面
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答复
答:如何使用集群profiler的富集
经过
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
如果您使用的是 *salmo salar *nbci基因id,并希望您可以使用一个``orgdb'',其中包含 *danio rerio *的ncbi基因ID,那么我c…
答案:GenomeInfodb ::: makenewseqnames中的错误
经过
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
如果您与基于Enembl的基因组保持一致,那么您的染色体就不会以“ CHR”开头。相反,它们将是1-22,X,Y,MT
答:Diffbind如何一起处理单端和配对数据
经过
1831513
•0
非常感谢您的帮助!按照您的脚本,我得到了单端和配对数据的正确读数,并运行DBA.A…
答案:diffbind:高度错误 * sapply(称为,函数(x)x)
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
我假设您已经更新了原始帖子以来的软件?`sessionInfo()`的当前输出是什么。如果您可以给我发送一个链接…
评论:conc_1在differnet dba中。报告结果略有不同
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
`dba.plotma()`使用`(abs(fold)> = fold)&(fdr <= th)`。对于集中问题,如果您可以向我发送一个可以访问您的链接…
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答案:txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene“ txname”不再是UCSC样式,但
答:Diffbind如何一起处理单端和配对数据
答:用DESEQ2中的APEGLM解释LFCSHRINK()的结果
答:通过不平衡组大小的桅杆单细胞RNA-seq分析
单细胞RNA-seq分析通过不平衡组大小的桅杆
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