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deseq2
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38
的观点
矩阵未满秩(单组协变量时间序列实验)
DESeq2
DES
1天前
heikki.sarin
•0
•17小时前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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35
的观点
DESeq2交互作用需要基因型条件代码
DESeq2
方差分析
条件
genotypeeval
1天前
丹
•0
•1天前更新
ATpoint
•380年
1
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3.
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65
的观点
lfc命令后的奇怪结果(收缩)
lfcshrinkage
DESeq2
2天前
尼科
•0
•2天前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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2
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70
的观点
无法加载数据“pasillaGenes”在R,因为DESeq没有安装?
DESeq2
pasillaGenes
2天前
kanhasunny
•0
•1天前更新
ATpoint
•380年
0
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4
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79
的观点
在DESeq2中运行DE时发生错误
DESeq2
2天前
kokyriakidis
•0
•1天前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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1
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37
的观点
类属特异性的治疗效果
DESeq2
differentialexpressionanalysis
3天前
L_K
•0
•3天前更新
迈克尔的爱
31 k
4
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83
的观点
弥散估计和MA图
DESeq2
3天前•1天前更新
hazwanfikri0505
•20
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54
的观点
差异表达的RNAseq,没有复制
DESeq2
NOISeq
刨边机
3天前
忒弥斯
•0
•2天前更新
ATpoint
•380年
3.
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3.
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58
的观点
重命名rownames手动(res)
DESeq2
7天前
e .码头
•10
3.
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84
的观点
包含DESeq2结果的基因集检测
烤
DESeq2
GeneSetEnrichment
7天前
prabin.dm
•0
•7天前更新
戈登•史密斯
41 k
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44
的观点
DESeq2配对分析矩阵
DESeq2
8天前
georgina.fqw
•0
•8天前更新
迈克尔的爱
31 k
1
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73
的观点
DESeq2作为WGCNA的输入
WGCNA
DESeq2
8天前•2天前更新
块钱
•0
2
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9
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158
的观点
library(HTSFilter)说“HTSFilter”不存在
DESeq2
HTSFilter
8天前
伊恩
•0
•7天前更新
andrea.rau
•80年
1
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43
的观点
用矩阵数据集进行微分表达式分析时的误差
DESeq2
DifferentialExpression
Bioconductor
9天前
didemdkn
•0
•9天前更新
迈克尔的爱
31 k
3.
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4
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140
的观点
Diffbind和DESeq2的剪切和运行规范化
GenomicLocalization
DESeq2
急忙逃走
Diffbind
归一化
10天前•8天前更新
莫妮卡
•20
0
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44
的观点
函数createExpressionSet:创建一个ExpressionSet -需要哪个包?
ExpressionData
11天前
蔓
•0
•9天前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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2
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104
的观点
DESEQ2的差异表达控制两个因素
DESeq2
13天前
蔓
•0
•12天前更新
ATpoint
•380年
5
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6
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146
的观点
如何添加列到DESeq2类型对象的summarizeexperimental元数据?
DESeq2
SummarizedExperiment
26天前•13天前更新
mschmidt
•10
0
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6
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159
的观点
如何切换b/w分叉和没有分叉的DESeq2
DESeq2
14天前
sergei.ponomarev
•0
•13天前更新
马丁•摩根
25 k
2
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3.
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95
的观点
DESEQ2 coldata创建从featu从新和row.names长度错误
DESeq2
16天前
NGS_enthusiast
•0
•15天前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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1
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61
的观点
DESeq2为三因素实验设计
DESeq2
RNASeq
16天前
microPhD
•0
•16天前更新
迈克尔的爱
31 k
4
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7
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711
的观点
DESeq2一组与多组比较存在批效应
deseq2
比较
批处理
16个月前
amin.ghareyazi
•0
•17天前更新
Joana.silvestre
•0
3.
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2
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71
的观点
DESeq2方差稳定转换:为什么assay()不同于getVarianceStabilizedData()?
DESeq2
19天前
a.giachino2
•0
0
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5
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113
的观点
DESeq2有很多异常值
DESeq2
20天前
dequattro.concetta
•10
•19天前更新
迈克尔的爱
31 k
4
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7
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556
的观点
通过DiffBind与DESeq2相互作用
diffbind
deseq2
的相互作用
3.2年前
rbronste
•60
•20天前更新
罗里斯塔克
♦3.5 k
0
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2
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57
的观点
在pheatmap上添加选定的行名
R
pheatmap
21天前
ecg1g15
•0
•21天前更新
ATpoint
•380年
0
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4
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87
的观点
使用用户指定的矩阵时,通过向results()提交一个名称列表来澄清返回的结果
DESeq2
23天前•22天前更新
thadryan
•0
2
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2
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73
的观点
在DESeq2正常化
DESeq2
归一化
28天前•22天前更新
蔓
•0
5
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6
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124
的观点
DESEq2中DEG和TopVarGenes的区别是什么?
DESeq2
R
RNASeqR
23天前•22天前更新
ecg1g15
•0
5
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6
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200
的观点
用方差稳定转化和tximport R包进行原始RSEM基因表达估计的转化
DESeq2
威仕特
rsem
tximport
26天前•23天前更新
svlachavas
•760年
0
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2
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51
的观点
结合DESeq2输出和biomart查询来显示DE基因而不是DE ensembl id
DESeq2
23天前
琳达
•0
•23天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
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4
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397
的观点
DESeq2 DFrame错误
DESeq2
6周前
安娜
•10
•23天前更新
迈克尔的爱
31 k
2
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1
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63
的观点
在“estimatedispersion”函数中多线程的可能性
DESeq2
24天前
侯赛因
•0
•24天前更新
迈克尔的爱
31 k
7
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5
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143
的观点
正常到DESEq2中的管家基因
DESeq2
管家
R
RNASeqData
28天前•25天前更新
ecg1g15
•0
3.
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6
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159
的观点
DESeq2中不同的对比编码策略产生的输出略有不同?
DESeq2
RNASeqData
DifferentialExpression
29天前
本
•0
•25天前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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2
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70
的观点
使用复杂的、用户指定的矩阵和事后显著性测试提取DESeq2结果
DESeq2
27天前•25天前更新
thadryan
•0
2
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1
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58
的观点
scRNA-seq伪体的DE基因表达
DESeq2
SingleCell
28天前
基督教
•0
•26天前更新
迈克尔的爱
31 k
0
票
1
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55
的观点
当我在终端中运行Deseq2时,结果与Snakemake不同
DESeq2
4星期前
大卫
•0
•26天前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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2
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58
的观点
组内变异对基因表达分析的影响
DESeq2
4星期前
hpapoli
•0
•26天前更新
迈克尔的爱
31 k
4
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3.
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112
的观点
理解DESeq2对比和p值
DESeq2
28天前
laura.baxter
•30
•26天前更新
迈克尔的爱
31 k
6
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7
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4.0 k
的观点
选择最优适合型进行分散估计的最佳方法?
deseq2
4.7年前
Christoph
•10
•26天前更新
迈克尔的爱
31 k
11
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16
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10 k
的观点
DESeq2:添加注释(从数据帧)到DESeqDataSet
deseq2
注释
农庄
6.2年前
Darya Vanichkina
•120年
•26天前更新
mschmidt
•10
0
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1
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58
的观点
执行从pcaData和coldata在DESeq2,也许pcattools ?
PCAtools
biplot
DESeq2
RNASeq
主成分分析
4星期前
ecg1g15
•0
•29天前更新
凯文Blighe
2.2 k
2
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4
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156
的观点
比较3个无DESeq2对照的RNASeq组
方差分析
RNASeqData
tukeyTest
DESeq2
4周前•29天前更新
ecg1g15
•0
0
票
5
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135
的观点
DESeq功能在笔记本电脑上很快,但在服务器上非常慢
DESeq2
4星期前
Saroop
•0
1
投票
2
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121
的观点
分析公开可用的DESeq2归一化差分表达式计数
DifferentialExpression
DESeq2
归一化
4星期前
krovi138
•0
•4周前更新
迈克尔的爱
31 k
0
票
2
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89
的观点
如何从沙土图中删除树状图?
pheatmapr
DESeq2
Bioconductor
5周前
Khawlah
•0
•4周前更新
圭多Hooiveld
♦2.8 k
2
票
5
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177
的观点
lfcShrink误差
lfcShrink
DESeq2
6周前
克劳迪奥·Carril
•0
•4周前更新
tcalvo
•40
2
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3.
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111
的观点
样本内基因相关性归一化
刨边机
归一化
DESeq2
tpm
RNASeq
5周前
tcalvo
•40
•4周前更新
戈登•史密斯
41 k
0
票
2
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51
的观点
p调整值不可用
StatisticalMethod
DESeq2
5周前
玛丽
•0
•5周前更新
凯文Blighe
2.2 k
3,239个结果•页
65年1
最近……
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注释:cnetplot(中化plot)的颜色刻度不是居中为0,偏向正负
通过
圭多Hooiveld
♦2.8 k
所以如果我理解正确的话,你不喜欢cnetplot使用的默认颜色梯度(即蓝-白-红),而是喜欢…
答案:矩阵未满秩(一组协变量时间序列实验)
通过
迈克尔的爱
31 k
链接到我刚才在另一篇文章上的回答:https://support.bioconductor.org/p/97705/#p133790
注释:DESeq2模型-如何在考虑wi时测试用例/控制时间过程模型
通过
迈克尔的爱
31 k
如果你控制受试者,你不需要(也不能)控制受试者水平的协变量。但是,这样的统计设计考虑到……
注释:ReadAffy不考虑参数sampleNames与表型数据对象
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
这不是affy包的问题,也不是ReadAffy包的问题。问题是,你正在创建一个不匹配的“表型数据”对象……
注释:ReadAffy不考虑参数sampleNames与表型数据对象
通过
bastien_chassagnol
•0
谢谢你的回复,但是我不希望我的显数据的row.names与我在文件名中读取的文件相匹配,我想要它匹配,当…
票
答:阅读。idat函数读取压缩文件时发生误导错误
答:阅读。idat函数读取压缩文件时发生误导错误
使用元素列表从hg38检索相同GC内容和长度的区域
使用元素列表从hg38检索相同GC内容和长度的区域
C: clusterProfiler -在dotplo中基因的生成和nb总是呈正相关的
奖
•所有
先知
来
heikki.sarin
•0
欣赏
来
托马斯Girke
♦1.7 k
很好的问题
来
珍妮Drnevich
♦2.0 k
学生
来
珍妮Drnevich
♦2.0 k
很好的问题
来
svlachavas
•760年
位置
•所有
印度,
23分钟前
美国,
53分钟前
美国,
1小时前
爱尔兰共和国,
1小时前
CRUK,剑桥,英国,
1小时前
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