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刨边机
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56
的观点
RNAseq无重复差异表达
DESeq2
NOISeq
刨边机
4天前
忒弥斯
•0
•3天前更新
ATpoint
•380年
1
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1
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78
的观点
磨边机变量调整的加性模型
刨边机
12天前
science555111
•0
•12天前更新
Yunshun陈
•680年
2
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93
的观点
多因素实验中批量效应的解决
刨边机
BatchEffect
RNASeq
29天前
anikng
•0
•20天前更新
SamGG
•250年
0
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2
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61
的观点
“三位一体差分表达式”在没有RSEM估算丰度的标准化原始计数上工作得如何
三一
DifferentialExpression
RSEM
RNAseq
刨边机
22天前
harelarik
•50
1
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5
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123
的观点
edgeR是否适用于HUMANnN2的metatranscripomics的UNIref特征的差异丰度?
刨边机
HUMAnN2.0
4周前•28天前更新
尼克
•0
1
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3.
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178
的观点
在EdgeR中计算log2FC
刨边机
log2FC
14个月前
matteo.buti
•0
1
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2
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70
的观点
烤制(煎制)基因组检测与偏移
EDASeq
刨边机
limma
4周前•29天前更新
gprezza
•0
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61
的观点
使用edgeR进行组织特异性差异表达——考虑模型中的其他影响
刨边机
DifferentialExpression
五星期前
小茉莉
•0
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3.
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108
的观点
基因表达与表型的Pearson相关性
刨边机
RNASeq
五星期前
weichengz
•0
•5周前更新
戈登•史密斯
41 k
2
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3.
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112
的观点
样本内基因相关性归一化
刨边机
归一化
DESeq2
tpm
RNASeq
五星期前
tcalvo
•40
•5周前更新
戈登•史密斯
41 k
2
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107
的观点
EdgeR中的治疗和性
刨边机
五星期前
science555111
•0
•5周前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
5
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3.
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113
的观点
edgeR支持连续协变量?
刨边机
7周前•6周前更新
艾薇
•0
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3.
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123
的观点
edgeR::filterByExpr()返回意外结果
刨边机
8星期前
阿克塞尔
•0
•7周前更新
戈登•史密斯
41 k
4
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3.
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80
的观点
没有重复的EdgeR分析-如何使用设置的分散值运行精确的测试?
刨边机
7周前
bertb
•0
•7周前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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3.
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64
的观点
在EdgeR中的偏移和归一化
刨边机
DifferentialExpression
7周前
ognjen011
•0
•7周前更新
戈登•史密斯
41 k
1
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8
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217
的观点
EdgeR中的Spike-in规范化
CUTandRUN
刨边机
归一化
SpikeIn
ChIPSeq
7周前更新
别哭
•0
0
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1
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70
的观点
使用DESEQ/EdgeR估计相对于控制的微分表达式。
刨边机
DifferentialExpression
8星期前
各向异性
•0
•7周前更新
迈克尔的爱
31 k
0
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1
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46
的观点
edgeR rrbs estimateDisp永远运行,似乎没有结束
刨边机
8星期前
阿卡纳
•0
•8周前更新
戈登•史密斯
41 k
1
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1
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65
的观点
DiffBind用于ATAC-Seq计数提取
esATAC
刨边机
DiffBind
8星期前
蒂莫西
•0
•8周前更新
罗里斯塔克
♦3.5 k
2
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2
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118
的观点
对数变换或者不是因变量/协变量
limma
刨边机
8星期前
anna.cot.anna.cot
•30
•8周前更新
戈登•史密斯
41 k
2
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10
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175
的观点
组间及组内edgeR配对时间课程实验设计
刨边机
diffcyt
limma
DifferentialExpression
8星期前
哈贾尔
•0
2
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2
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124
的观点
配对分析调整RIN值
limma
刨边机
8星期前
anna.cot.anna.cot
•30
•8周前更新
戈登•史密斯
41 k
3.
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2
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156
的观点
用于tx级DE的catchSalmon
catchSalmon
刨边机
9周前•8周前更新
ATpoint
•380年
7
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8
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259
的观点
如何直接从最新边缘的DGEList对象中获取RPKM的基因长度?
归一化
刨边机
RPKM
9周前
anikng
•0
•8周前更新
戈登•史密斯
41 k
1
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0
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52
的观点
饮食后代谢物水平相关的差异基因表达
刨边机
9周前
anna.cot.anna.cot
•30
1
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3.
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90
的观点
过滤因子
刨边机
9周前
dojo89
•0
•9周前更新
戈登•史密斯
41 k
2
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3.
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73
的观点
多因子RNA序列的EdgeR设计矩阵
刨边机
设计
多因素
9周前
jackiesalzbank
•0
•9周前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
2
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7
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188
的观点
EdgeR diffSpliceDGE:获取外显子级计数和正常化步骤
刨边机
归一化
差异外显子使用
拼接
10周前
oakhamwolf
•0
•10周前更新
Yunshun陈
•680年
0
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2
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105
的观点
带有推断复制的单细胞数据的edgeR
刨边机
小鲑鱼
10周前
ATpoint
•380年
0
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4
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125
的观点
当SGSeq被传递给limma/edgeR时,我应该如何处理来自SGSeq的读计数
SGSeq
limma
刨边机
11星期前
zliu
•0
•10周前更新
伦纳德·戈尔茨坦
•110年
0
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136
的观点
在diffSpliceDGE中指定对比以测试嵌套效果
diffSpliceDGE
对比矩阵
刨边机
11星期前
rachel.steward
•0
•11周前更新
戈登•史密斯
41 k
3.
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3.
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156
的观点
任何时候都要理解交互问题
RNA-seq
刨边机
的相互作用
12周前
vm.higareda
•10
•11周前更新
戈登•史密斯
41 k
1
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151
的观点
在edgeR中,我应该如何测量BCV图的结果,常见离散度的值,tagwise disperson等。
刨边机
11星期前
science555111
•0
10
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10
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197
的观点
RNA-Seq Limma/edgeR分析,时间过程实验,异常结果
limma
刨边机
12周前
astigliani31
•10
•12周前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
3.
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1
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91
的观点
如何在edgeR中创建目标数据框架?
刨边机
RNA-SEQ
3个月前
泰拉
•0
•3个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
5
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2
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153
的观点
饮食后与血液参数变化相关的差异基因表达
刨边机
3个月前
anna.cot.anna.cot
•30
•3个月前更新
戈登•史密斯
41 k
6
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4
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125
的观点
边缘和批处理效果
刨边机
3个月前
chatterjee.arumoy
•10
•3个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
6
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5
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135
的观点
利用RNAseq数据计算少数基因的标准差
刨边机
RNAseq
3个月前
marhabaie
•0
•3个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
3.
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6
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103
的观点
3因子EdgeR设计矩阵
刨边机
全球语言监测机构
RNAseq
3个月前
jackiesalzbank
•0
•3个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
1
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1
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103
的观点
技术复制在WGCNA中
刨边机
3个月前
Ava_jm75
•0
•3个月前更新
彼得Langfelder
♦2.6 k
7
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4
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163
的观点
稀疏数据集的TMM归一化
刨边机
limma
3个月前
jc235601
•20
1
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4
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108
的观点
试图做一个PCA使用edgeR与表达式数据
刨边机
表达数据
主成分分析
3个月前
waalkes
•0
•3个月前更新
戈登•史密斯
41 k
3.
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4
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155
的观点
如何理解cpm=1和如何filterByExpr工作?
刨边机
3个月前
linouhao
•0
•3个月前更新
凯文Blighe
2.2 k
1
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115
的观点
eisaR设置为三个生物重复
eisaR
刨边机
3个月前
nishanthemje
•0
•3个月前更新
戈登•史密斯
41 k
2
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2
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107
的观点
RNA-Seq时间序列分析在EdgeR
刨边机
时间序列分析
3个月前
josmantorres
•10
•3个月前更新
戈登•史密斯
41 k
1
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3.
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117
的观点
TMM归一化矩阵从计数矩阵使用edgeR
刨边机
3个月前
hyojin0912
•0
•3个月前更新
戈登•史密斯
41 k
0
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1
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48
的观点
做cox和km图吗
limma
刨边机
3个月前
linouhao
•0
•3个月前更新
凯文Blighe
2.2 k
0
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2
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66
的观点
如何将数据规范化?
r
归一化
刨边机
3个月前
lakshmi9c
•0
•3个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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6
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81
的观点
系数不可估计
刨边机
3个月前
KJ Lim
•420年
•3个月前更新
戈登•史密斯
41 k
2
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119
的观点
RNA-seq差异分析所需的最小样本?
deseq2
limma
刨边机
3个月前
linouhao
•0
1653个结果
34分之1
最近……
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注:矩阵数据集差分表达式分析的误差
通过
迈克尔的爱
31 k
您可以从RSEM中四舍五入估计计数并提供给DESeqDataSetFromMatrix。我没有从T导入汇总数据的代码…
注:矩阵数据集差分表达式分析的误差
通过
didemdkn
•0
谢谢你的帮助。但是,我没有RSEM输出文件。我刚刚下载了TCGA-BRCA研究的3级数据,我只有…
答:使用BiocManager:: Install()在docker容器中不工作
通过
马丁•摩根
25 k
这些消息表明你在“代理”或“防火墙”后面,你需要遵循“设置代理”部分的说明。
注释:cnetplot(富贵图)中的颜色刻度不是以0为中心,而是向posiiti倾斜
通过
圭多Hooiveld
♦2.8 k
所以如果我理解正确的话,你不满意默认的颜色梯度“cnetplot”使用(即蓝-白-红),而是喜欢…
答:矩阵不是满秩的(一组和协变量的时间序列实验)
通过
迈克尔的爱
31 k
链接到我刚才在另一篇文章上的回答:https://support.bioconductor.org/p/97705/#p133790
票
答:阅读。Idat函数读取压缩文件时出错
答:阅读。Idat函数读取压缩文件时出错
使用元素列表从hg38中检索具有相同GC内容和长度的region
使用元素列表从hg38中检索具有相同GC内容和长度的region
C: clusterProfiler -在dotplo中,基因的GeneRatio和nb总是正相关的
奖
•所有
先知
来
heikki.sarin
•0
欣赏
来
托马斯Girke
♦1.7 k
很好的问题
来
珍妮Drnevich
♦2.0 k
学生
来
珍妮Drnevich
♦2.0 k
很好的问题
来
svlachavas
•760年
位置
•所有
德国,
53分钟前
爱尔兰共和国,
2小时前
海边的城市,
3小时前
瑞士,
4小时前
印度,
6小时前
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