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rnaseq
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51
视图
DESEQ2或EDGER的设计矩阵
EDGER
deseq2
rnaseq
2天前
Kimmcl860
•0
•2天前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
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36
视图
使用DESEQ2进行4种不同组细胞的RNA-seq分析
deseq2
rnaseq
5天前
Yonatan
•0
•5天前更新
Atpoint
•390
0
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128
视图
如何从RNASEQ数据中删除X&Y染色体基因
deseq2
rnaseq
15天前
建筑
•0
•12天前更新
阿努巴夫
•0
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269
视图
如何椭圆形的数据PCA双皮子?
双翼飞机
PCA
rnaseq
PCATOOLS
4周前
MSCHMIDT
•10
•4周前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
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4.2k
视图
在r中合并fastq.gz?(还是在Windows?)
rnaseq
生物导体
fastq
5.5年前
Mk.Applebee
•0
•5周前更新
拉斐尔
•0
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79
视图
带有三因素实验设计的DESEQ2
deseq2
rnaseq
5周前
Microphd
•0
•5周前更新
迈克尔·洛夫
31k
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113
视图
解决多因素实验中的批处理效应
EDGER
批处理效应
rnaseq
7周前
Anikng
•0
•6周前更新
萨姆格
•250
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71
视图
“ Trinity-differental-Expression”对标准化原始计数的工作状况如何,而无需RSEM丰度
三位一体
差异性
RSEM
rnaseq
EDGER
6周前
哈雷拉里克
•50
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1
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72
视图
在DESEQ2中从Pcadata和Coldata中执行双单行,也许是PCATOOLS?
PCATOOLS
双翼飞机
deseq2
rnaseq
PCA
7周前
ECG1G15
•0
•7周前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
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124
视图
基因表达与表型之间的皮尔逊相关性
EDGER
rnaseq
8周前
魏奇
•0
•8周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
2
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3
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136
视图
样本内基因相关性的归一化
EDGER
正常化
deseq2
TPM
rnaseq
8周前
tcalvo
•40
•8周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
3
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2
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74
视图
lfcshrink函数用于不同的比较
deseq2
rnaseq
9周前
bi.mi
•0
1
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1
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64
视图
DESEQ2批处理效果
批处理效应
deseq2
rnaseq
9周前
伊戈尔
•40
•9周前更新
迈克尔·洛夫
31k
0
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4
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95
视图
DESEQ2:30个样本的模型矩阵问题
deseq2
rnaseq
10周前
达古里姆
•0
2
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1
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55
视图
如何提取顶级DEG及其样品值
deseq2
rnaseq
11周前
ECG1G15
•0
•11周前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
0
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2
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102
视图
为什么与Kallisto的TPM相比,TPM的计数给出不同的值?
rnaseq
计数
TPM
GenomicFeatures
卡利斯托
11周前
M93
•0
•11周前更新
迈克尔·洛夫
31k
2
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3
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224
视图
用于计算“ scater”软件包中TPM的长度
评分
计算
rnaseq
3个月前
马坦·G。
•30
•12周前更新
亚伦·伦
♦26K
0
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95
视图
工作:
在发育神经生物学和生物信息学中的博士职位
rnaseq
神经生物学
TCGA
工作
12周前
劳伦特·加托(Laurent Gatto)
1.4k
3
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4
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150
视图
AntotationData for Affymetrix HT MG-430 PM阵列板
rnaseq
Affymetrix
鼠
3个月前
Olrema
•0
•3个月前更新
Guido Hooiveld
♦2.8k
0
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1
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117
视图
非本地GO注释不能成功引入Goseq
Goseq
rnaseq
r
3个月前
citronxu
•0
•3个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
6
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5
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161
视图
使用RNASEQ数据计算一些基因的标准偏差
EDGER
rnaseq
4个月前
玛哈伊
•0
•4个月前更新
史蒂夫·利亚诺格洛(Steve Lianoglou)
13k
3
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6
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117
视图
EDGER设计矩阵具有3个因素
EDGER
Glm
rnaseq
4个月前
Jackiesalzbank
•0
•4个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
0
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2
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135
视图
DESEQ2 +使用NoiseQ函数过滤低计数
deseq2
Noingsq
LowCounts
rnaseq
4个月前
安德烈
•0
•4个月前更新
迈克尔·洛夫
31k
1
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7
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104
视图
如何获得特定条件的多因素DESEQ LRT测试日志P值
deseq2
LRT
因素
rnaseq
4个月前
aishu.jp
•20
5
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8
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191
视图
排序仅在数据帧中使用字符和数字列中减少数字列(多个)
种类
r
rnaseq
特点
数字
4个月前
卡米拉布。
•10
•4个月前更新
内存
•60
0
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2
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132
视图
EDGER中的CPM功能
EDGER
CPM
rnaseq
4个月前
Francesca3
•0
0
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1
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86
视图
如何描述2个品种的时间序列RNA-seq数据的LRT测试条件
deseq2
LRT
rnaseq
(健康)状况
5个月前
aishu.jp
•20
•5个月前更新
迈克尔·洛夫
31k
1
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1
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90
视图
我可以为重复的基因添加原始计数吗?
deseq2
rnaseq
5个月前
尼古拉·伊万诺夫
•0
•5个月前更新
迈克尔·洛夫
31k
7
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11
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158
视图
EDGER中是否有接近嵌套ANOVA的模型?
EDGER
rnaseq
5个月前
DeepTiptl74
•0
•5个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
2
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2
答复
119
视图
EDGER批处理效果校正不均匀分布组
rnaseq
EDGER
批处理效果
5个月前
Rebecca.lea.Johnston
•0
•5个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
0
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1
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91
视图
弦乐输出作为球门输入
舞会礼服
Stringtie
星系
rnaseq
5个月前
lakshmi9c
•0
•5个月前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
0
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0
答复
76
视图
EDASEQ:是否有可能在车道内归一化多个协变量?
EDASEQ
正常化
GC
长度
rnaseq
5个月前
ABF
•30
1
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5
答复
119
视图
RNA SEQ数据的Spearman相关性
deseq2
rnaseq
统计
6个月前
Biom.andressa
•0
•6个月前更新
罗伯特·卡斯特罗(Robert Castelo)
♦2.6k
0
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8
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152
视图
log2fc和pvalue的deseq2怪异值。
deseq2
rnaseq
r
6个月前
Biom.andressa
•0
•6个月前更新
迈克尔·洛夫
31k
0
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3
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87
视图
DESEQ2设计模型和结果功能设置 - 如何知道使用交互项是否合适?
deseq2
rnaseq
6个月前
gmchaput
•0
•6个月前更新
迈克尔·洛夫
31k
0
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1
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59
视图
如何获取RNASEQ DTU工作流中提到的特定基因组?
rnaseqdtu
rnaseq
dexseq
deseq2
6个月前
Debatosh Das
•10
•6个月前更新
迈克尔·洛夫
31k
0
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9
答复
177
视图
ReactOMEPA错误图
r
rnaseq
块
去
Reactomepa
7个月前
卡米拉布。
•10
1
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6
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392
视图
更改Fontsize/删除注释complexHeatMap软件包的名称
r
rnaseq
复杂的图像
注解
7个月前
卡米拉布。
•10
•7个月前更新
Zuguang Gu
•210
0
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1
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80
视图
具有多个数字协变量的无法估计的VOOM Lima的系数
r
林玛
设计
rnaseq
VOOM
7个月前
将要
•0
•7个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
0
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0
答复
345
视图
工作:
UCLOUVAIN(比利时布鲁塞尔)DUVE Institute的研究软件工程师
软件工程师
rnaseq
蛋白质组学
工作
可视化
7个月前
劳伦特·加托(Laurent Gatto)
1.4k
2
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7
答复
143
视图
Limma分析有多个变量
林玛
model.matrix
de
设计
rnaseq
7个月前
将要
•0
•7个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
4
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14
答复
218
视图
Quantro的应用到RNASEQ:我没有得到与Quantro纸补充剂相同的结果
Quantro
rnaseq
8个月前
RAF4
•20
•7个月前更新
斯蒂芬妮·希克斯(Stephanie Hicks)
•80
2
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1
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128
视图
跨物种分析和DESEQ2归一化
正常化
deseq2
跨物种
rnaseq
7个月前
RMurray2050
•0
•7个月前更新
迈克尔·洛夫
31k
1
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8
答复
126
视图
[除外基因去除] - 某些基因的一个样本具有离群值的样本
rnaseq
deseq2
离群值
计数
DE分析
8个月前
DCL-A
•0
•8个月前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
1
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2
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76
视图
RSEM预期计数的TXIMPORT:是否可以从表而不是文件导入?
tximport
林玛
rnaseq
8个月前
艾德
•50
•8个月前更新
迈克尔·洛夫
31k
2
投票
2
答复
97
视图
如何从GEO分析数据集
地理
rnaseq
deseq2
TPM
8个月前
andrej.stoll.de
•10
•8个月前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
5
投票
3
答复
92
视图
Limma中的多层次实验
林玛
rnaseq
r
8个月前
A.Barden
•10
•8个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
2
投票
4
答复
109
视图
批处理和治疗效果之间完全混淆
批处理效果
林玛
批处理
rnaseq
Ruvseq
8个月前
bhakti.dwivedi
•0
•8个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
2
投票
4
答复
106
视图
GO/KEEG富集非模型细菌 - 初学者的帮助
细菌
去
凯格
rnaseq
8个月前
liz.marjory
•0
0
投票
8
答复
101
视图
怪异的ma-plot(deseq2)
deseq2
rnaseq
9个月前
jgarces
•0
1,041结果•页面
21中的1
最近的 ...
答复
答:如何使用集群profiler的富集
经过
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
如果您使用的是 *salmo salar *nbci基因id,并希望您可以使用一个``orgdb'',其中包含 *danio rerio *的ncbi基因ID,那么我c…
答案:GenomeInfodb ::: makenewseqnames中的错误
经过
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
如果您与基于Enembl的基因组保持一致,那么您的染色体就不会以“ CHR”开头。相反,它们将是1-22,X,Y,MT
答:Diffbind如何一起处理单端和配对数据
经过
1831513
•0
非常感谢您的帮助!按照您的脚本,我得到了单端和配对数据的正确读数,并运行DBA.A…
答案:diffbind:高度错误 * sapply(称为,函数(x)x)
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
我假设您已经更新了原始帖子以来的软件?`sessionInfo()`的当前输出是什么。如果您可以给我发送一个链接…
评论:conc_1在differnet dba中。报告结果略有不同
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
`dba.plotma()`使用`(abs(fold)> = fold)&(fdr <= th)`。对于集中问题,如果您可以向我发送一个可以访问您的链接…
投票
答案:txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene“ txname”不再是UCSC样式,但
答:Diffbind如何一起处理单端和配对数据
答:用DESEQ2中的APEGLM解释LFCSHRINK()的结果
答:通过不平衡组大小的桅杆单细胞RNA-seq分析
单细胞RNA-seq分析通过不平衡组大小的桅杆
奖项
• 全部
预言家
至
伊利斯
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流行问题
至
索菲·马里恩·德·普罗斯
•0
预言家
至
Jol.espinoz
•30
史诗般的问题
至
Jol.espinoz
•30
流行问题
至
JMA1991
•40
位置
• 全部
美国,
1分钟前
德国,
5分钟前
爱尔兰共和国,
12分钟前
纽约市,
16分钟前
Embl Heidelberg / de.nbi,
24分钟前
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