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rsubread
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5
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26
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2.3 k
的观点
在某些注释上,Rsubread:: featurewrite异常慢
rsubread
featurecounts
5.9年前
莱恩·c·汤普森
7.6 k
•6周前更新
杨廖
•220年
0
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3.
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105
的观点
Rsubread无法返回对齐
Rsubread
对齐
7周前
丹尼尔
•0
•7周前更新
杨廖
•220年
5
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6
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1.3 k
的观点
使用featurets创建计数矩阵,用于搁浅和反向搁浅,单个以及配对端库
rsubread
2.8年前
7月
•0
•9周前更新
bjwiley23
•0
0
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3.
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237
的观点
软件包“#####”是在R 4.0.0之前安装的:请重新安装
Bioconductor
RNASeqData
DESeq2
Rsubread
10周前
拉斐尔
•0
•10周前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
0
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0
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55
的观点
SEQ-QVALs SAM/BAM字段在featureCounts的工作流程中是必要的吗?
Rsubread
featureCounts
3个月前
martinag.work
•0
5
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11
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190
的观点
Rsubread:在接受混合成对端和单端文件时改变行为
软件错误
Rsubread
7个月前
barrel0luck
•0
•7个月前更新
戈登•史密斯
42 k
2
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5
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101
的观点
Rsubread featurets中未分配的读取
Rsubread
8个月前
am39
•0
•8个月前更新
施魏
♦3.3 k
3.
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5
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129
的观点
featurets chrAliases没有正常工作
Rsubread
9个月前
kathleen.e.grogan
•0
•9个月前更新
杨廖
•220年
1
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2
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70
的观点
Rsubread buildindex错误
Rsubread
9个月前
zliu
•0
•9个月前更新
施魏
♦3.3 k
0
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4
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149
的观点
Rsubread - buildindex上的错误-大引用序列
Rsubread
10个月前
bryan.penning
•0
•10个月前更新
杨廖
•220年
0
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4
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104
的观点
使用align from Rsubread,导致内存未映射
Rsubread
对齐
10个月前
约瑟夫·法斯
•70年
4
票
4
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One hundred.
的观点
加载BAM文件的问题是由特性重述引起的
featurecount
rsubread
GenomicAlignments
10个月前
Konstantinos叶尔
•50
0
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12
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139
的观点
使用Rsubread在索引文件中使用负1个“-1”值
软件错误
rsubread
10个月前
peter.r.hoyt
•0
•10个月前更新
杨廖
•220年
0
票
1
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92
的观点
Rsubread:在与fork进程对齐时使用共享内存进行索引
rsubread
13个月前
nsantanderg
•0
•13个月前更新
施魏
♦3.3 k
2
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6
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204
的观点
无法识别基因id
dexseq
rsubread
featureCount
软件错误
14个月前
seung.ho.steven.choi
•0
•13个月前更新
杨廖
•220年
5
票
6
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309
的观点
Rsubread malloc():内存损坏
Rsubread
malloc
对齐
17个月前
Konstantinos叶尔
•50
•15个月前更新
戈登•史密斯
42 k
1
投票
1
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167
的观点
用Rsubread复制bowtie2对齐参数
Rsubread
15个月前
dktanwar1991
•0
•15个月前更新
施魏
♦3.3 k
2
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3.
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138
的观点
Rsubread雪茄输出M ?
Rsubread
雪茄
16个月前
lauren.fitch
•0
•16个月前更新
戈登•史密斯
42 k
2
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5
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315
的观点
Rsubread请求霰弹枪RNAseq数据的长读模式
Rsubread
计数RNA-seq
16个月前
莫特
•0
•16个月前更新
杨廖
•220年
2
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1
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205
的观点
当从Rsubread使用buildindex时,“错误:不能创建临时文件”
软件错误
Rsubread
buildindex
16个月前
efernandez
•0
•16个月前更新
戈登•史密斯
42 k
2
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6
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1.4 k
的观点
在win10中安装Rsubread失败,如何继续?
rsubread
windows10
rtools
3.6年前
Yisong甄
•200年
•16个月前更新
杨廖
•220年
11
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1
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293
的观点
新闻:
Rsubread现在可用于Windows
rsubread
新闻
17个月前•16个月前更新
戈登•史密斯
42 k
1
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2
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794
的观点
Rsubread包不可用?
Rsubread
BiocInstaller
9.2年前
诺亚道
•410年
•17个月前更新
戈登•史密斯
42 k
4
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3.
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724
的观点
Rsubread, featurets配对结束时出错
Rsubread
成对的结束
featureCounts
19个月前
hauken_heyken
•70年
•18个月前更新
施魏
♦3.3 k
1
投票
3.
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432
的观点
在macOS Mojave上为Rsubread buildindex杀死9
Rsubread
buildindex
死亡9
莫哈韦沙漠
19个月前
raabec
•0
•19个月前更新
施魏
♦3.3 k
0
票
1
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157
的观点
是否可以使用NOISeq从RSubread计数?
noiseq
rsubread
大礼帽
领结
bowtie2
19个月前
马塞洛拉娅
•440年
2
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3.
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259
的观点
箱线图函数不显示x轴上的所有读取长度
箱线图
读取
fastq
测序
rsubread
20个月前
Raito92
•40
•20个月前更新
施魏
♦3.3 k
2
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1
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305
的观点
Rsubread安装问题
Rsubread
BiocParallel
20个月前
agustin.gonvi
•10
•20个月前更新
戈登•史密斯
42 k
1
投票
1
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181
的观点
featurets不能正确解析文件名
Rsubread
featureCounts
20个月前
wunderl
•20
•20个月前更新
戈登•史密斯
42 k
3.
票
9
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804
的观点
featualcults在量化混合成对和未成对读取时计数错误
rsubread
featureCounts
21个月前
k.vitting.seerup
•100年
•21个月前更新
施魏
♦3.3 k
5
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6
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340
的观点
改进Rsubread中的align函数对旧Roche454读取的性能
对齐
rsubread
roche454
rnaseq
21个月前
Raito92
•40
•21个月前更新
施魏
♦3.3 k
3.
票
7
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459
的观点
Rsubread内置注释
rsubread
featureCounts
21个月前
diego.carvalhoalvarez
•0
•21个月前更新
戈登•史密斯
42 k
4
票
2
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319
的观点
Subread在提供错误标识的成对结束读时给出段错误
subread
Rsubread
21个月前
乔纳森·格里菲思
•30
•21个月前更新
戈登•史密斯
42 k
7
票
5
回复
724
的观点
featucounts返回一个充满0的计数矩阵…
featureCounts
rnaseq
Rsubread
21个月前
Raito92
•40
•21个月前更新
戈登•史密斯
42 k
12
票
7
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348
的观点
没有方法强制这个S4类到一个向量,因为试图导入我自己的数据,而不是在工作流RnaSeqGeneEdgeRQL中使用SRA
rnaseqgeneedgerql
shortread
Rsubread
22个月前
Raito92
•40
•22个月前更新
Aspie96
•60
2
票
6
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367
的观点
exon_id上的Rsubread ERROR
R
错误
软件错误
Rsubread
featurecounts
22个月前
edejong
•0
•22个月前更新
施魏
♦3.3 k
1
投票
2
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249
的观点
在featurets中导入文本文件的问题
Rsubread
featureCounts
22个月前
estevemp
•0
•22个月前更新
戈登•史密斯
42 k
3.
票
4
回复
328
的观点
路径错误
路径
Rsubread
2.0年前
memoly101
•0
•23个月前更新
cellfixnowusa
•0
3.
票
13
回复
717
的观点
Rsubread特性计数
注释
Rsubread
featureCounts
2.0年前
memoly101
•0
2.0年前更新
戈登•史密斯
42 k
0
票
2
回复
572
的观点
使用read.delim导入数据
limma
rsubread
2.1年前
justinkablan225
•0
•2.1年前更新
戈登•史密斯
42 k
0
票
9
回复
541
的观点
将FASTQ文件映射到单个基因(荧光报告)
rsubread
对齐
对齐
2.1年前
一个
•40
0
票
9
回复
746
的观点
计数外显子的特征计数问题:与特定基因的总计数不匹配
featurecounts
Rsubread
ggbio
2.2年前
一个
•40
•2.2年前更新
施魏
♦3.3 k
2
票
1
回复
291
的观点
Rsubread用于微生物组数据分析:基因组>4GB
对齐
rsubread
微生物组
2.2年前
埃文·约翰逊
•830年
•2.2年前更新
施魏
♦3.3 k
0
票
16
回复
1.1 k
的观点
使用人类基因组索引时出错
rsubread
buildindex
fasta
对齐
2.2年前
writetoroopali
•0
4
票
7
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1.8 k
的观点
将featurets的基因ID转换为entrez基因ID
biomart
rsubread
gencode
2.3年前
YinCY
•20
•2.3年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
1
投票
2
回复
422
的观点
我不能使用Rsubread。先谢谢你。
rsubread
2.5年前
Mithil Gaikwad
•0
•2.5年前更新
戈登•史密斯
42 k
3.
票
4
回复
416
的观点
使用dupRadar::analyzeDuprates时文件未发现错误
dupradar
rsubread
2.5年前
b.nota
•340年
•2.5年前更新
戈登•史密斯
42 k
0
票
4
回复
438
的观点
在Rsubread-DESeq2过程中,环状RNA是否以线性片段的形式被读出
deseq2
circrna
rsubread
2.6年前
csijst
•0
•2.6年前更新
施魏
♦3.3 k
0
票
8
回复
671
的观点
featucounts返回0.0%成功分配的片段
rsubread
featurecounts
2.6年前
connor.geraghty
•0
9
票
16
回复
925
的观点
Rsubread安装失败,“无法加载共享对象Rsubread.so”
rsubread
2.7年前•2.6年前更新
jet456
•10
142个结果•页面
三选一
最近……
回复
答案:Conc_1在differnet dba。报告结果略有不同
通过
罗里斯塔克
♦3.5 k
这些异常已在' DiffBind_3.0.12 '中解决。
答:在DiffBind中,比较结果score和Conc不一样
通过
罗里斯塔克
♦3.5 k
你的代码进行比较的方式有一些问题:-正在运行的对比又比较了两个BT474样本…
注释:3个因素和相互作用的edgeR模型矩阵
通过
ahsindoomilup
•0
亲爱的云顺,我不确定如何从MDS图中确定线性或非线性效应。这是我从MDS图中得到的信息…
答案:TopGO:显著的GO项,但在这个GO项中0个基因显著(与elimi -k
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
有可能你把事情混为一谈了。elim/weight/classic方法与所使用的测试是正交的。前者只是……
备注:从ENST到eng
通过
圭多Hooiveld
♦2.8 k
不,在谷歌上快速搜索发现[此信息/轨道][1](在UCSC基因组浏览器):V26 (Ensembl 88)....的所有GENCODE注释
票
回答:当从GEOquery中使用getGEO()时,发生了一个错误:文件不存在
评论:DESeq分析与生物复制。
备注:从ENST到eng
答:从ENST到ENSG
在RStudio中加载DEP时出错
奖
•所有
很好的问题
来
komal.rathi
•80年
史诗的问题
来
komal.rathi
•80年
欣赏
来
马修·里奇
•950年
受欢迎的问题
来
s.munster
•40
欣赏
来
肖恩·戴维斯
21日k
位置
•所有
爱尔兰共和国,
7分钟前
克鲁克,剑桥,英国
9分钟前
意大利/Sassari/Università di Sassari,
10分钟前
德国,
58分钟前
美国,
1小时前
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