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rtracklayer
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86
的观点
R包rtracklayer安装状态问题
rtracklayer
Bioconductor
12天前•11天前更新
svlachavas
•770年
1
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5
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126
的观点
RStudio vs R:使用rtracklayer从http导入bigwig文件在R中有效,但在RStudio中无效。
import.bw
rtracklayer
http
RStudio
6周前
Søren
•0
•6周前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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0
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61
的观点
如何提升配对的床(床)数据
rtracklayer
7周前
米哈伊尔·Dozmorov
•10
3.
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8
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2.0 k
的观点
导入一个BED文件与浮点分数?
rtracklayer
床上
4.8年前
莱恩·c·汤普森
7.6 k
•9周前更新
凯文Blighe
2.3 k
0
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44
的观点
当使用rtracklayer导入时,可以直接计算覆盖率的汇总统计吗?
报道
rtracklayer
9周前
大卫
•0
2
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2
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81
的观点
如何访问GAlignments对象的元数据
rtracklayer
Rsamtools
GAlignments
农庄
元数据
8个月前
罗伯特。
•10
•8个月前更新
Herve页面
14 k
1
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1
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One hundred.
的观点
Rtracklayer导出Granges对象为bigwig错误:特征不能重叠
rtracklayer
genomicranges
农庄
9个月前
ssabri
•20
•9个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
7
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13
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275
的观点
如何使用GenomicScores提取所有蛋白质编码基因和lncrna的phastcons评分?
genomicscores
农庄
phastCons100way.UCSC.hg38
r
rtracklayer
10个月前
生物学家
•90年
•10个月前更新
罗伯特Castelo
♦2.6 k
0
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4
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83
的观点
Rtracklayer: Windows下在r中导入bigwig文件时出错
rtracklayer
有重大影响的文件
10个月前
mzwanelen
•0
0
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1
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54
的观点
从ucsc基因组浏览器获取snp和酶切位点
rtracklayer
10个月前
prabin.dm
•0
•10个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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1
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45
的观点
Rtracklayer在没有cd的情况下无法导出TxDb为GFF3
rtracklayer
11个月前
alexis.weinreb
•0
•11个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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0
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111
的观点
Rsamtools / rtracklayer为BAM文件创建csi索引
rsamtools
rtracklayer
14个月前•13个月前更新
ATpoint
•390年
1
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2
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105
的观点
Rtracklayer::导出空分数
rtracklayer
14个月前
dinocolmillo
•0
•14个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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4
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288
的观点
IRanges:解决第5行:无法从提供的参数确定范围(太多NAs)
IRanges
rtracklayer
14个月前
jovel_juan
•10
•14个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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0
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95
的观点
DMDeepm6A: solve_user_SEW0", start, end, width, PACKAGE = "IRanges .
rtracklayer
IRanges
DMDeepm6A
14个月前
jovel_juan
•10
2
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3.
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267
的观点
OSX中的rtracklayer对CRAN不可用,导致下游依赖项出现错误。
GenomicRanges
rtracklayer
VariantAnnotation
S4Vectors
SummarizedExperiment
18个月前
james.dalgleish
•30
•18个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13 k
0
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0
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118
的观点
Rtracklayer导入bigwig错误
rtracklayer
18个月前
ribioinfo
•90年
0
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1
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221
的观点
从GFF3数据为非系统生物/ denovo程序集创建完整的TXDB对象
GenomicFeatures
rtracklayer
20个月前
stephane.plaisance
•10
•20个月前更新
Herve页面
14 k
4
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1
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256
的观点
重写grange的seqinfo的推荐方法是什么?
农庄
seqinfo
import.bw
BigWigFile
rtracklayer
22个月前
maltethodberg
•140年
•22个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
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7
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246
的观点
如何在rtracklayer中设置轨道属性
rtracklayer
browserView
browserSession
22个月前
焚风
•60
•22个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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4
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297
的观点
从grange分数改变符号以可视化负链数据
农庄
rtracklayer
23个月前
ferbecneu
•0
•23个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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1
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252
的观点
如何在rtracklayer中根据特定的基因列表对gff进行过滤?
rtracklayer
人造石铺地面
过滤器
23个月前
alslonik
•0
•23个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
3.
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3.
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350
的观点
rtracklayer::导入氨基酸fasta序列的错误
rtracklayer
fasta
进口
Biostrings
23个月前
k.vitting.seerup
•100年
•23个月前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
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1
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574
的观点
rtracklayer BigBed格式
总会在
rtracklayer
bigbed
2.0年前
焚风
•60
2.0年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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12
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1.9 k
的观点
使用错误未定义符号安装rtracklayer: OPENSSL_init_ssl(系统Centos7.3 R3.5.1 openssl-1.1.1)
软件错误
rtracklayer
bioconductor
openssl
2.1年前
ruan_wei_dong
•0
0
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1
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399
的观点
rtracklayer::导出问题。从wig文件的mm9升格到mm10后,unlisted创建的GRanges对象的bw
rtracklayer
export.bw
liftover
2.1年前
盎
•20
•2.1年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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2
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931
的观点
如何将床罩转换为假发
rtracklayer
genomicranges
2.1年前
ferbecneu
•0
•2.1年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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7
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329
的观点
rtracklayer不能导出空的BED文件
rtracklayer
床上
genomicranges
2.2年前
焚风
•60
•2.2年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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3.
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461
的观点
browseGenome与Shiny
rtracklayer
browsegenome
闪亮的
2.3年前
vivek82
•0
•2.3年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
3.
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2
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1.0 k
的观点
将fasta文件转换为.2bit格式
BioStrings
rtracklayer
2.3年前
saripalligautam86
•10
•2.3年前更新
Herve页面
14 k
1
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10
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558
的观点
rtracklayer export bedGraph不能加载到UCSC
rtracklayer
2.4年前
尼古拉斯的仆人
•260年
•2.4年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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4
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636
的观点
导入链-不能导入链文件
rtracklayer
2.4年前
kipperf
•0
•27天前更新
axel.thieffry
•10
0
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1
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264
的观点
motifs命令从bigWig文件导入motifs
R
rtracklayer
数据导入
2.5年前
stefan.dvoretskii
•0
•2.5年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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1
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343
的观点
makeTxdbFromUCSC下载失败
maketxdbpackagefromucsc
rtracklayer
genomicfeatures
2.5年前
lalchungnungabt17
•0
•2.5年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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2
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385
的观点
不能安装rtracklayer - make: *** [ucsc/os。错误1
rtracklayer
2.6年前
creasyt
•0
3.
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6
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779
的观点
UCSC和rtracklayer的问题:'names'属性[210]必须和向量[209]的长度相同
rtracklayer
加州大学
ensgene
2.7年前
chrisamiller
•0
•2.7年前更新
马克斯
•10
0
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1
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408
的观点
rtracklayer::liftOver参数(minMatch)
rtracklayer
liftOver
参数
minMatch
2.8年前
尼克驿站
•10
•更新于2.8年前
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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2
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386
的观点
rtracklayer colorByStrand -是否可以添加引号?
rtracklayer
2.8年前
珍妮特年轻
•740年
0
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1
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316
的观点
导入带有轨道线的床文件失败
rtracklayer
2.8年前
cbaribault
•0
•更新于2.8年前
迈克尔•劳伦斯
11 k
1
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2
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354
的观点
Rtracklayer演示错误
rtracklayer
2.8年前
felix.ernst
•0
0
票
4
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711
的观点
Gviz IdeogramTrack failed with Error:加载HTTP资源失败
gviz
gviz-package
rtracklayer
http
3.0年前
enricoferrero
•570年
1
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1
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419
的观点
Seqnames vs chrom
BiocGen
rtracklayer
genomeinfodb
3.0年前
felix.ernst
•0
•3.0年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
票
6
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664
的观点
为granges对象添加列,在范围内求和得分
R
Grang
r
农庄
rtracklayer
3.0年前
ssabri
•20
•3.0年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
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4
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1.1 k
的观点
可能的Rtracklayer问题:TxDb错误在GenomicFeatures包-无法从UCSC加载TxDb标准参数(问题开始于昨晚)
genomicfeatures
txdb
maketxdbfromucsc
maketxdbfrombiomart
rtracklayer
3.1年前
james.dalgleish
•30
•3.1年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
0
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0
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403
的观点
带有转录长度功能的信息缺失
bioconductor
genomicfeatures
rtracklayer
transriptlengths
3.1年前
michael.soutschek
•0
0
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2
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508
的观点
当使用rtracklayer时,如何获取UCSC url,在url中包含轨道,这可能是非常有用的
rtracklayer
加州大学
ucsctrack
3.1年前
zhangqshxxzz
•0
•3.1年前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
55 k
0
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1
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533
的观点
错误:分别在goseq和rtracklayer包中使用ucscGenomes()和supportedGenomes()函数时,下标越界
goseq
rtracklayer
3.3年前
mgdrnl
•0
1
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2
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392
的观点
UCSC无法显示音轨
rtracklayer
3.3年前
zhangqshxxzz
•0
1
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2
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586
的观点
rtracklayer可以导入tab分隔的BED文件,字段中有不带引号的空格吗?
rtracklayer
床上
软件错误
3.3年前
莱恩·c·汤普森
7.6 k
•3.3年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
2
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2
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595
的观点
normSplitFactor(f, x)错误
GenomicRanges
rtracklayer
goseq
3.3年前
mictadlo
•0
•3.3年前更新
迈克尔•劳伦斯
11 k
230个结果•页
五分之一
最近……
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注释:在特定位置用另一个核苷酸序列替换特定的核苷酸序列
通过
Konstantinos叶尔
•40
你好@Benjamin-24571为你的例子,我可以建议你这段代码:读取<- c("1","2","3","4")序列<- c("ACACCCACG", "AA…
评论:芯片序列分析由DiffBind包
通过
shrinka.genetics
•0
您好,感谢您的回复。我改变了我的文件格式,现在它运行了。它也给了一块地。所有文件都在同一个目录下。不…
答:在Docker中安装Bioconductor包
通过
Konstantinos叶尔
•40
你好,@adklt -21974我在docker中安装包的方法是这样的:FROM bioconductor/bioconductor_docker…
评论:HTqPCR:处理技术重复(过滤类别)和无法肛门
通过
larissa.stanberry
•0
我也遇到了同样的问题。过滤似乎不携带featureData除了featurename,例如调用featureD…
备注:设计矩阵为DESeq2或EdgeR
通过
凯文Blighe
2.3 k
在Biostars上交叉发布:https://www.biostars.org/p/484823/
票
答:Biocthis GHA最近在macOS上失败了
答案:Limma帮助(创建设计矩阵)
注释:两种具有不同文库大小的批量RNA数据集的归一化
如何更好地设计一个火山情节
用生物串中的另一个核苷酸序列替换特定位置的特定核苷酸序列
奖
•所有
先知
来
ilysR
•0
受欢迎的问题
来
苏菲·玛丽恩·德·普罗斯
•0
先知
来
jol.espinoz
•30
史诗的问题
来
jol.espinoz
•30
受欢迎的问题
来
jma1991
•40
位置
•所有
海边的城市,
42分钟前
WEHI,澳大利亚墨尔本,
2小时前
意大利萨莱诺大学,
7小时前
美国,
7小时前
爱尔兰共和国,
7小时前
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