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25
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EPIC阵列单复制管道?
minfi
methylationArrayAnalysis
更新1小时前by
詹姆斯·w·麦克唐纳
•写于1天前
伞形花耳草
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24
的观点
放大时,Gviz feature注释消失
Gviz
更新1小时前by
詹姆斯·w·麦克唐纳
by
svenbioinf
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15
的观点
无法在NCBI的.gff文件上使用ensembldb的"ensDbFromGff()"函数
ensembldb
RNASeq
2小时前更新
Torkel
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19
的观点
不同的基因使用相同的方法
DESeq2
1小时前更新
menuka
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11
的观点
champ.SVD(): Error in while (step == 0) {: missing value where TRUE/FALSE needed
methylationArrayAnalysis
EPICarray
冠军
冠军。圣言会
6小时前
arisarkar88
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85
的观点
当我试图通过limma移除非差异表达基因时,我得到了一个警告
RNASeqData
更新5小时前by
ATpoint
▴550•写了7小时前
Rishav
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20.
的观点
解码包在dada2 -实现Silva_metaxa2训练集从qza文件到fastq.gz/.Rdata
解读
dada2
9小时前
anrongloh
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28
的观点
CUT&Tag差分峰分析使用Diffbind,与预先计算的归一化因子。
DiffBind
16小时前
mwong043
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28
的观点
错误生成计数df使用DRIMSeq/DEXseq
DRIMSeq
DEXSeq
22小时前
jbono
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37
的观点
错误与hclust
系统树图
hclust
textanalysis
R
RStudio
更新于21小时前
凯文Blighe
27k•写了22小时
阿比盖尔
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22
的观点
新闻:
用户句柄更改站点
Bioconductor
处理
1天前
natay.aberra
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34
的观点
读取连接时出错(url(con)))
TCGAbiolinks
•更新3小时前
xiaofeiwang18266
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22
的观点
新闻:
更新BiocFileCache、AnnotationHub和ExperimentHub
BiocFileCache
AnnotationHub
ExperimentHub
缓存
1天前
shepherl
2.6 k
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17
的观点
用conumee总结CNV图
conumee
1天前
melpag
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22
的观点
在不考虑批量效应的情况下应用exomeCopy调用CNVs
exomeCopy
CNV
韦斯
1天前
程
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19
的观点
DiffBind没有使用DESeq2 MLE估计褶皱变化
DiffBind
1天前
山姆
▴10
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3.
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51
的观点
estimateDisp, glmQLFit和glmQLFTest如何处理我的TMM规范化读计数矩阵?
刨边机
glmQLFTest
glmQLFit
estimateDisp
更新1天前by
詹姆斯·w·麦克唐纳
•写于1天前
朱塞佩
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24
的观点
读取SDS格式的qPCR数据时出错
HTqPCR
1天前
Nghia
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81
的观点
DiffBind DEseq
DiffBind
2天前•5小时前更新
浩然
•0
6
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2.9 k
的观点
教程:
访问Bioconductor的公共基因组数据
geoquery
geometadb
sradb
教程
2天前更新
鲁班雷克斯
•0•写于5.8年前
肖恩·戴维斯
21日k
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114
的观点
多因子的设计矩阵
designmatrix
RNA-seq
limma
2天前更新
戈登•史密斯
12天前写的
athief
▴10
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108
的观点
对于tabix来说,VCF文件太大。最好的选择,使它与R?
samtools
tabix
VariantAnnotation
VCFArray
3天前更新
小文森特·j·凯里
4周前写的
天真的
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3.
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One hundred.
的观点
GEO + RNA-seq。完全的新手。
RNASeqData
RNASeq
地理
RNASeqR
帮助
3天前•2天前更新
hgalmoore
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35
的观点
ChIPseeker下游的注释
下游
优先级
ChIPseeker
4天前
小姐程
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113
的观点
R会话中止:prcomp
Biobase
统计数据
4天前更新
凯文Blighe
2.7k•10天前写的
Gero
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67
的观点
Limma Voom设计和对比矩阵-我的参数也可以是一个因素吗?
RNASeqRData
limma
RNASeq
RNASeqR
4天前更新
戈登•史密斯
5天前写的
丽塔
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26
的观点
匹配模式函数用于R中的多个模式
matchPattern
自动
Biostrings
for循环
4天前
adklts
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33
的观点
IRanges / Granges对象的平均覆盖图
IRanges
5天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
5天前写的
n.mary
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23
的观点
Gviz导入lor从bam文件读取
Gviz
longreads
5天前
ginlucks
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42
的观点
错误与Rhtslib
Rhts
Rhtslib
5天前
anand_mt
▴80
2
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40
的观点
新闻:
2021年Bioconductor社区新顾问委员会成员
bioconductoroversight
新闻
社区
BiocVersion
5天前
马修·里奇
▴990
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28
的观点
提取无参考基因组的侧翼序列SNP
SNPData
snpStats
单核苷酸多态性
flankingsequences
5天前
琥珀色的
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81
的观点
TxDbfromGFF的基因组特征错误
GenomicFeatures
TxDb
6天前•5天前更新
sieminsk
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10
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177
的观点
如何运行Goseq查询集合基因id列表
goseq
8天前•3天前更新
幸运的
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32
的观点
新闻:
SBGNview关于bioRxiv的手稿
通路
SBGNview
Reactome
pathview
豹
5天前更新
楚
•0•写于6天前by
罗Weijun
★1.5 k
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3.
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83
的观点
Aspli: gbCounts错误
Aspli
ASpli
22小时前更新
achernomoretz
•0•写于14天前by
jbono
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135
的观点
我在设计矩阵的时候出现了一个错误,请帮助我解决
RNASeqR
6天前更新
Basti
▴60•作者6天前
Rishav
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63
的观点
可以ENmix:: oxBS。MLE是根据战斗调整数据运行的吗?
ENmix
战斗
6天前
joannew
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95
的观点
基因ID转换用于差异表达基因的通路富集分析
GeneIDConversion
AnnotationForge
7天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
•写于8天前
AbhilashKumar。特里帕西
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42
的观点
如何分位数归一化arraystar lncRNA芯片数据?
limma
微阵列
7天前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
•写于7天前
a.deb
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28
的观点
工作:
意大利,米兰,IEO,计算癌症生物学博士后
TCGAbiolinks
BiomedicalInformatics
网络
7天前
martin.schaefer
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58
的观点
使用重新计数数据来计算内含子保留率
snapcount
recount3
重新计票
7天前更新
莱昂纳多Collado托雷斯
▴870•写于8天前
马列拉议会洛佩兹
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78
的观点
vom -limma工作流的RNAseq样本与非常不同的计数数
轰
limma
RNASeq
7天前
annadv
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96
的观点
Pheatmap/Complexheatmap:使用NAs制作连续的颜色比例
R
通路
pheatmap
limma
8天前更新
SamGG
▴270•写作9天前by
r.i.s.alnuwaysir
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3.
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104
的观点
Illumina的长基因优先测序?
DESeq2
测序
9天前更新
victorbradford4
•0•写于9天前by
simplyphage
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81
的观点
edgeR中的选择性剪接分析:重复的外显子
刨边机
Rsubread
10天前•8天前更新
jbono
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94
的观点
如果整个样本的计数很低,P值可靠吗?
DESeq2
测序
10天前
simplyphage
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42
的观点
工作:
北卡罗莱纳大学夏洛特分校的生物统计学/生物信息学研究科学家
R
统计数据
singlecellRNA-Seq
pathview
工作
10天前
罗Weijun
★1.5 k
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95
的观点
无模块成员> 0.8的基因
wgcna
WGCNA
hubgenes
10天前更新
Vivek
▴20•写于11周前
汉娜
▴10
3.
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138
的观点
模块保存vs共识分析
WGCNA
wgcna
10天前更新
Vivek
▴20•写于6周前
Colari19
▴20
40,486个结果•页
810年1
最近……
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注释:用读组拆分BAM文件
通过
sbcn
▴70
亲爱的马丁,非常感谢你!我得出了相同的结论,关于使用filterBam代替,因为我正在与地图a…
评论:不同的基因使用相同的方法
通过
menuka
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谢谢你,迈克尔。
回答:EPIC array单复制管道?
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
如果你设置了没有截距的设计矩阵,那么你就是在计算每组的均值,然后如果你测试显著性……
答:放大时,Gviz特性注释消失
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
[Gviz用户指南][1]的第4.4节涵盖了这个主题。[1]: //www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/vignettes/Gviz/in..。
答:无法在NCBI的.gff文件上使用ensembldb的"ensDbFromGff()"函数
通过
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
你试图假装你的GFF是来自NCBI的。(那样做没有好处。)相反,接受这个事实…
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注释:用读组拆分BAM文件
答案是:不同的基因使用相同的方法
注释:从连接读取错误(错误加载(url(con)))
注释:用读组拆分BAM文件
评论:当试图通过limma移除非差异表达基因时,我是ge
奖
•所有
学者
来
圭多Hooiveld
★2.9 k
学者
来
迈克•史密斯
★4.9 k
学者
来
詹姆斯·w·麦克唐纳
56 k
老师
来
戈登•史密斯
42 k
受欢迎的问题
来
shepherl
2.6 k
位置
•所有
意大利,
刚才
戴维斯
2分钟前
弗吉尼亚州伍德布里奇
4分钟前
荷兰瓦赫宁根大学,
8分钟前
达勒姆
14分钟前
流量:过去一小时内访问了325个用户
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